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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003851`

染色体: Chr04 坐标: 54492199-54495611 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003851`
名称	SmilChr04G003851
描述	FT-interacting protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54492199 - 54495611 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020645`
GeneID	`131020645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020645`
原始查询	`SmilChr04G003851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FT-interacting protein 3-like
产物	FT-interacting protein 3-like
Arabidopsis	`AT4G11610` (AT4G11610) C2 calcium/lipid-binding plant phosphoribosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826766] identity=61.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0683800` - identity=64.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF08372 (PRT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057805574.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057805574.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057805574.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057805574.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057805574.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54492524`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr4:54492524`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr4:54492532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54492588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr4:54492620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B107,B7,C16,C33
`Chr4:54492625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54492807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:54492845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54492931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,D11
`Chr4:54492987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B48,B98,C53,D4
`Chr4:54492990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B35,C47
`Chr4:54493017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805574.1

1003 aa

502

1003

PRT_C

PF00168 C2 6-96 aa PF00168 C2 268-358 aa PF00168 C2 430-533 aa PF00168 C2 593-703 aa PF08372 PRT_C 848-1003 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805574.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	6	96	3.3e-75	249.7	C2 domain
`XP_057805574.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	268	358	3.3e-75	249.7	C2 domain
`XP_057805574.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	430	533	3.3e-75	249.7	C2 domain
`XP_057805574.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	593	703	3.3e-75	249.7	C2 domain
`XP_057805574.1`	Pfam	`PF08372`	PRT_C	Family	848	1003	4.6e-75	251.4	Plant phosphoribosyltransferase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949591.1
CTTGTTTATGATCAACCCATCCCAGCACGATTCAAATGTAATCAATTATCTGCTAAACACTTTTTAAGCTTATAAGCCGTTGAGTTCAACCAAACACCCCCTTAATCTTGTCACAAAAAATCAACGTTAATTTAAAACGACTTTTCATTATCTTTTATTTAATGACTTCTTCTTTCTTCCTCGAATTTTCCTCTTAATTCATGTTGCAAGCATTACTTGTGTGCATATATCTTGCAATGCTTTGAATACTTCAATCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020645
ATGAACAACAACTTGAAGCTAGCAGTGGACGTTGTGCGAGCCCACAACCTCCTCCCCAAAGACGGCCAAGGATCCTCGAGCGCCGCCGTGGAGCTGGTCTTCGATGGCCAGAAGTTCCGCACCACCATCAAGGAGAGAGACCTCAACCCCTTCTGGAACGAGACCTTCTACTTCAACGTCGCCAATCCACTCGACCTCCACCACCTCACCCTCGAGGCCCACCTCTTCAGCATCAACAAGACCACCGGGAAGAAATACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805574.1
MNNNLKLAVDVVRAHNLLPKDGQGSSSAAVELVFDGQKFRTTIKERDLNPFWNETFYFNVANPLDLHHLTLEAHLFSINKTTGKKYSLGKLRINGTSFVPLPDAVVFNYPLEKNGLFSSTRGELALKVYLTGDLASSPLVNHHEASSTSSLHSIHDEPSPPRRNEEKASSRRSLYTLSGTDHHHHPQQQQQQQQRVSTPSMPSYQAPQFSASEMRFEPQASQSARMHPNSSSSQPADFALKETNPVLGGGGRVRSSSLYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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