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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003852`

染色体: Chr04 坐标: 54495685-54500833 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003852`
名称	SmilChr04G003852
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54495685 - 54500833 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020701`
GeneID	`131020701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020701`
原始查询	`SmilChr04G003852`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 9-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 9-like
Arabidopsis	`AT2G33620` (AT2G33620) AT hook motif DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817928] identity=45.4; qcov=0.645; evalue=9.66e-43; confidence=medium
Rice	`Os04g0589900` (OsAHP1) - identity=42.9; qcov=0.674; evalue=1.07e-39; confidence=medium
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805671.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805671.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805671.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805671.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54496491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54496554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:54496561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr4:54497085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B18,B55,C34,C83
`Chr4:54497842`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C46,C73
`Chr4:54499581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54499665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54499848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805671.1

301 aa

150

301

PCC

PF03479 PCC 156-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805671.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	156	269	1.8e-25	90.1	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949688.1
GAGAGATATCCACCAAGCGCCTGCTGCTGCTCTCTCCTGTTCAAGATTTTCTCTTTCTATCTCTACAAGCAAACAACCGCGCACCACACTAACTCAAAACCCGCATCACTCCTCACTCTATCACCTCATCACACACTACACACAGTGAGCCACAACACACACAAATTCACAGCACAAAAAAAGAGTCTTTCCTCACAAAAAATGCATTACGTTTCGGATAAGAATTCTTTCACTGTTATGGTGAGTTCATCAATGGCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020701
ATGGATCAAAGGGAAGCTATAACGCTGCAAGGTTCGGCCTCCTATTATCTTCATCAAGGAAATGCAGAGTCTGTCATGGGACTACAGGGATCCCCTGGCATGAATTCGATGTCTAATCCTGGTTTGCACTATCAAACCAACACCGGGAGGAATATGATTGGATCATCATTACCTTTAGATACTTCATCGACAATGTCACCTCATGGAATGAGTGTTGGCCCACCTCCTGCGCTTGGTGTAGGTCCGCCTCCTGCTATGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805671.1
MDQREAITLQGSASYYLHQGNAESVMGLQGSPGMNSMSNPGLHYQTNTGRNMIGSSLPLDTSSTMSPHGMSVGPPPALGVGPPPAMMQGEPVRRKRGRPRKYGRDSAVSLALSPSTSNPVPFVRPAQKRRGRPPGTGRKHQEIPLGGSIFTGPGKLVPHIINVAVGEDIKRKVLSFAQGRQSTVILSGNGTISAVNIRISSSGGSVTYEGRFDILSLTGSYAQNDVNAPHGPVGCLNVTLSGPDGRVIGGGVDGVMLAGS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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