当前解析结果
SmilChr04G003853| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003853 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003853 |
| 描述 | rho GTPase-activating protein 4-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 54503389 - 54505994 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020747 |
|---|---|
| GeneID | 131020747 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020747 |
| 原始查询 | SmilChr04G003853 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | rho GTPase-activating protein 4-like |
| 产物 | rho GTPase-activating protein 4-like |
| Arabidopsis | AT3G11490 (AT3G11490)rac GTPase activating protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820322] identity=62.3; qcov=0.53; evalue=2.94e-14; confidence=low |
| Rice | Os07g0408500 (P0492E07.106)- identity=68.2; qcov=0.44; evalue=5.08e-14; confidence=low |
| GO | GO:0005096 (GTPase activator activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020747 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057805745.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057805745.1 |
| 3 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057805745.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057805745.1 |
| 5 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057805745.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:54503844 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C2,C35 |
Chr4:54503859 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B133,B135,B48,B75 |
Chr4:54503874 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr4:54505095 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,B40 |
Chr4:54505130 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。