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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003868`

染色体: Chr04 坐标: 54578005-54583615 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003868`
名称	SmilChr04G003868
描述	signal peptide peptidase-like 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54578005 - 54583615 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020662`
GeneID	`131020662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020662`
原始查询	`SmilChr04G003868`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal peptide peptidase-like 2
产物	signal peptide peptidase-like 2
Arabidopsis	`AT1G63690` (SPPL2) SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842673] identity=76.2; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0823000` (SPPL4) - identity=71.6; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005765 (lysosomal membrane); GO:0030660 (Golgi-associated vesicle membrane); GO:0033619 (membrane protein proteolysis); GO:0042500 (aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving); GO:0098553 (lumenal side of endoplasmic reticulum membrane); GO:0098554 (cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02225 (PA); PF04258 (Peptidase_A22B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057805615.1`
2	Endosome	内体	0.40000	`XP_057805614.1`
3	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057805614.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805615.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057805615.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54579043`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C3
`Chr4:54579043`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C3
`Chr4:54580061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B137,B2,B37,B49
`Chr4:54580324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54580378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:54581783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B9,C48,D2
`Chr4:54582147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:54582351`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A11,B103,B108,B11,B117,B138,B19,B25,B82,B94,C16,C23,C45,C62,D10
`Chr4:54582391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A11,B103,B108,B11,B117,B138,B19,B25,B82,B94,C16,C23,C45,C62,D10
`Chr4:54582960`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A11,B103,B108,B11,B117,B138,B19,B25,B82,B94,C16,C23,C45,C62,D10
`Chr4:54583014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B97
`Chr4:54583015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805614.1

540 aa

270

540

Peptidase_A22B

PF02225 PA 91-167 aa PF04258 Peptidase_A22B 244-525 aa

XP_057805615.1

409 aa

204

409

Peptidase_A22B

PF04258 Peptidase_A22B 113-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805614.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	91	167	1.8e-13	51.1	PA domain
`XP_057805614.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	244	525	8.7e-100	334.7	Signal peptide peptidase
`XP_057805615.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	113	394	4.1e-100	335.8	Signal peptide peptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949631.1
ATGGAGCTCACCACCAGACTTCTCTACTCTCATTTTCCTGCGCTTGCTCTGTTGCTATGCACTTCCGTCGTGTTTGCTGGCGATATAGTTCACCAAGATGATATTGCTCCGAAGAAGCCTGGTTGCGACAACAATTTCGTGCTGGTTAAAGTACCTATTTGGTTAGATGGTGTTGAGGTATCACAATTCGTTGGTATTGGTGCTCGATTTGGTCCGACATTGGAATCAAAGGAGAAGCGAGCCAACCAGATTATAGTGAC...

XM_057949632.1
TCTCTGTTAGCATAGCACAGTTTTTTCATAGGAAATCATGATAGTGTTATAGTTTTCTTGTTACCTGAACACCGTTCACAATTTCGACTAAATGGATTCGCTTCATAGCACATATACTTTTTTTTAGAAATGCGCATGGTTCTTTAAGTAGTGTTTTCTGGTTTTTTAATGTAAAATATTGTAATATCCGTAGCTCTACCCATATGCCGTTCCCAGTATCCAATTAAAAGTTTTATAGGACTGATCCATGGATCATTACG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020662
ATGGAGCTCACCACCAGACTTCTCTACTCTCATTTTCCTGCGCTTGCTCTGTTGCTATGCACTTCCGTCGTGTTTGCTGGCGATATAGTTCACCAAGATGATATTGCTCCGAAGAAGCCTGGTTGCGACAACAATTTCGTGCTGGTTAAAGTACCTATTTGGTTAGATGGTGTTGAGGTATCACAATTCGTTGGTATTGGTGCTCGATTTGGTCCGACATTGGAATCAAAGGAGAAGCGAGCCAACCAGATTATAGTGAC...

LOC131020662
ATGGTGCTAATCTATTGTCCAGAACTCTTCAAGATGGTGTGTGAGAAAAATGAGACTGATGTAGATGTTGGCATTCCTGTAGTCATGCTTCCGCAAGATGCTGGTGGAAGCTTGAAAGAAAGCATGAGAAACAGTTCGCACGTTTCCATTCAGATTTACTCGCCGAAACGCCCGTTGGTTGATGTTGCTGAAGTGTTTTTATGGCTCATGGCTGTTGGTACTGTCTTATGTTCATCTTATTGGTCTGCGTGGAGTGCTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805614.1
MELTTRLLYSHFPALALLLCTSVVFAGDIVHQDDIAPKKPGCDNNFVLVKVPIWLDGVEVSQFVGIGARFGPTLESKEKRANQIIVTLADPPDCCSKPKNKLTGEAILVHRGNCSFVTKANVAEAAGASALLIINNQTELFKMVCEKNETDVDVGIPVVMLPQDAGGSLKESMRNSSHVSIQIYSPKRPLVDVAEVFLWLMAVGTVLCSSYWSAWSAREAAIEQDKLLKDGFDEHLTSDTHHSNGLIEINTASAIFFVVF...

XP_057805615.1
MVLIYCPELFKMVCEKNETDVDVGIPVVMLPQDAGGSLKESMRNSSHVSIQIYSPKRPLVDVAEVFLWLMAVGTVLCSSYWSAWSAREAAIEQDKLLKDGFDEHLTSDTHHSNGLIEINTASAIFFVVFASCFLVMLYKLMSYWFIEILVVVFCIGGVEGLQTCLVAILACFRWFEHAAESFVKVPVLGSVSYLTLAVSPICIAFSVLWAVYRSASIAWIGQDILGIALIITVLQIVRIPNLKVGTVLLSCSFLYDIFWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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