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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003873`

染色体: Chr04 坐标: 54618739-54624545 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003873`
名称	SmilChr04G003873
描述	ascorbate transporter, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54618739 - 54624545 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020660`
GeneID	`131020660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020660`
原始查询	`SmilChr04G003873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ascorbate transporter, chloroplastic-like
产物	ascorbate transporter%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G00370` (ANTR2) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827908] identity=65.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0570400` (OsPT24) probable anion transporter 4, chloroplastic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4347913] identity=64.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805612.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057805612.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805612.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805612.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54619008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B3,C23,C38
`Chr4:54620322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B28,B30
`Chr4:54620354`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B2
`Chr4:54620354`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B2
`Chr4:54620361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr4:54620510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B87
`Chr4:54620597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:54620691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B136,C73,C78
`Chr4:54620712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54621739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C24,C60
`Chr4:54621753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54622123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,C46,C58,D11,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805612.1

613 aa

306

613

MFS_1

PF07690 MFS_1 209-572 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805612.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	209	572	2.3e-58	198.5	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949629.1
ATAAGATTCAGCTGATATTCTGTATGAAGAGCAACGGCTCCATGTGTTATCCACTTTTAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGTCACATTCTACTGAATCTACTCACAGAAAATCTCAAGTTTCATACTGATAATAATATCTCAATCGCTGTATCTATAGCTGCGACATGGCAGCGTGAATCGAAAACACTTGGAGTTGGAGCCGAAGAGAATTTTCCGGTGGCGATGGCAATCAGCGCCGTCGTTTCGCACCGGAATTTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020660
ATGGCAATCAGCGCCGTCGTTTCGCACCGGAATTTCGGCTGTTTCATCGGTTCTGGACGAGTTTATCATAGAGGAACACCATCAGATCGTCAAAGATGCCAGCATTCAAGTGTCAGTGCGGTGCAGTATGTGAATAAAAAAATGTTCTGCAGCTATCATCCGGCGGCACGCTTTTCATTTGGCTATGTGTATCAGTCATCCATTCCTGCTGAAGATAAACCATACAGGGAAATCCCAAGATCAAAGCTGATGTCTCATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805612.1
MAISAVVSHRNFGCFIGSGRVYHRGTPSDRQRCQHSSVSAVQYVNKKMFCSYHPAARFSFGYVYQSSIPAEDKPYREIPRSKLMSHLNLDPVLITSHQTSNKLTSMNKRVKSRGAYECCLSSAYSDAGGIQTRKLDKLGFSYGQKPPSKHITVMRTRAEFKSEEHNNTSTEFETLVSSEGASEAALPVGAEPAKPWGSQLPKRWVMVLLCFAAFLLCNMDRVNMSIAILPMSKEFNWSSATVGLIQSSFFWGYLLTQIIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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