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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003875`

染色体: Chr04 坐标: 54626923-54629303 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003875`
名称	SmilChr04G003875
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54626923 - 54629303 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020726`
GeneID	`131020726`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020726`
原始查询	`SmilChr04G003875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 5-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 5-like
Arabidopsis	`AT1G63800` (UBC5) ubiquitin-conjugating enzyme 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842683] identity=88.7; qcov=0.839; evalue=9.35e-93; confidence=high
Rice	`Os10g0447100` (OsUBC10) - identity=90; qcov=0.833; evalue=9.02e-95; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020726

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805718.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805718.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805719.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805720.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805720.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54627167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B55
`Chr4:54627221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B37,B59
`Chr4:54627225`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B119
`Chr4:54627225`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B119
`Chr4:54627279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C28
`Chr4:54627295`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	B119,B121,B127,B38,B39,B4,B54,B57,B6,C19,C23,C30,C37,C63,D11
`Chr4:54627301`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A9,B114,B122,B139,B140,B19,B3,B44,B49,B5,B61,B64,B65,B69,B81,B83,B91,B97,C14,C32,C38,C41,C43,C5,C51,C6,C7,C82,C83,C85,D2
`Chr4:54627338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A10,A25,A6,A7,B100,B117,B125,B51,B6,B67,B80,B81,B90,B92,B95,C1,C26,C44,C67,C79,C87
`Chr4:54627782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr4:54627793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54627860`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	44	A14,A2,A21,A3,A5,A8,B10,B103,B115,B122,B23,B28,B30,B35,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B5,B50,B55,B56,B58,B6,B68,B8,B82,B96,C10,C17,C31,C32,C36,C46,C64,C75,C76,C78,D11,D3,D7
`Chr4:54627918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805718.1

184 aa

184

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-142 aa

XP_057805719.1

185 aa

185

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-140 aa

XP_057805720.1

168 aa

168

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805718.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	142	2.3e-39	134.9	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057805719.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	140	1.2e-38	132.6	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057805720.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	141	3.9e-39	134.2	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949735.1
AGGTGACTGTGGAATTGCCCATGTGTGCATATACATGTATTATTACAAATGCATATATGAATTAATTCATTCATCTTCTCAACCTTGCTTCTTTAACTTGAACAAGTAACTTCATTCTTCATCTCTTTCTCTCTCATCCCTCGTTTCCCTTCTCCAAAGAGAGAGAAGCAAGCTCAGAAATTACAACTAAATTCAAGAATTTCAACATGTCTTCCCCAAGCAAGAGGCGCGAGATGGACTTGATGAAATTGTTGATGAGT...

XM_057949737.1
TTAATTCATTCATCTTCTCAACCTTGCTTCTTTAACTTGAACAAGTAACTTCATTCTTCATCTCTTTCTCTCTCATCCCTCGTTTCCCTTCTCCAAAGAGAGAGAAGCAAGCTCAGAAATTACAACTAAATTCAAGAATTTCAACATGTCTTCCCCAAGCAAGAGGCGCGAGATGGACTTGATGAAATTGTTGATGAGTGATTACAAGGTGGAGATGATCAATGATGGGATGCAGGAGTTTTATGTGCATTTTCACGGCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020726
ATGTCTTCCCCAAGCAAGAGGCGCGAGATGGACTTGATGAAATTGTTGATGAGTGATTACAAGGTGGAGATGATCAATGATGGGATGCAGGAGTTTTATGTGCATTTTCACGGCCCCAGTGAGAGTCCTTACCACGGCGGTGTATGGAAAATACGGGTGGGGCTTCCTGATGCATACCCGTACAAGTCTCCTTCGATAGGATTTATTAACAAGATGTACCATCCCAATGTGGATGAAATGTCGGGTTCCGTGTGTTTGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057805718.1
MSSPSKRREMDLMKLLMSDYKVEMINDGMQEFYVHFHGPSESPYHGGVWKIRVGLPDAYPYKSPSIGFINKMYHPNVDEMSGSVCLDVINQTWSPMFDLVNVFEVFLPQLLLYPNPSDPLNGEAAALMLRDRPAYEQRVKEYCQKYAKPEDVGAVPEEEESSDEELSEDGSDSSDDEVAGPVDP

XP_057805719.1
MSSPSKRREMDLMKLLMSDYKVEMINDGMQEFYVHFHGPSESPYHGGVWKIRVGLPDAYPYKSPSIGFINKMYHPNVDEMSGSVCLDVINQTWSPMFDLVNVFEVFLPQLLLYPNPSDPLNGEAAALMLRDRPAYEQRVKGNQSFFLSCEARGVAYRIVWSFYESFRLVSLIDFKWIMLNSCSLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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