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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003879`

染色体: Chr04 坐标: 54642432-54645582 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003879`
名称	SmilChr04G003879
描述	cyclin-A3-2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54642432 - 54645582 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023636`
GeneID	`131023636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023636`
原始查询	`SmilChr04G003879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-A3-2-like
产物	cyclin-A3-2-like
Arabidopsis	`AT1G47210` (CYCA3;2) cyclin-dependent protein kinase 3;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841124] identity=54.7; qcov=0.703; evalue=1.39e-47; confidence=medium
Rice	`Os01g0233100` - identity=45; qcov=0.774; evalue=2.08e-33; confidence=medium
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0044772 (mitotic cell cycle phase transition)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809164.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809164.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809164.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809164.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54644650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C23,C69
`Chr4:54644663`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A8,A9,B100,B113,B129,B132,B20,B28,B29,B38,B39,B73,B76,B93,C1,C12,C14,C15,C27,C52,C53,C59,C61,D5,D7
`Chr4:54644669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B78
`Chr4:54644749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C33
`Chr4:54644763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B35
`Chr4:54644789`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A11,A2,A3,A7,A9,B107,B115,B124,B28,B30,B31,B32,B38,B39,B40,B48,B58,B65,B74,B8,B9,C16,C17,C31,C32,C35,C37,C40,C45,C56,C60,C68,C76,C80,C9
`Chr4:54644866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:54645282`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B107,B140,B68,C42
`Chr4:54645282`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B107,B140,B68,C42
`Chr4:54645316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:54645317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54645356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809164.1

195 aa

195

Cyclin_N

PF00134 Cyclin_N 98-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809164.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	98	181	2.4e-17	63.5	Cyclin, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953181.1
AAATGGAAAAAATTGTTCCAACTTTCTATTTGTTCGTTTTTTTCCCCAAATGCCAAAGAAAAGCCCTTGAGGAGAATTCCCCAAATCCATAGCGAGAAAGCTTTCATCTTGGATGCTTTGAGGAGAAGATTCGTGTTGAATGATAAGCCGAAAAGCAAACCCCGGAGGAATGTGAAGATAGTGAAAGCCGGTGGAGCTAAGGAGGTGAAGATCTCTAAAGCTGAGACCGATCCCGCCATTGATTTGGACGGGAAATCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023636
AAATGGAAAAAATTGTTCCAACTTTCTATTTGTTCGTTTTTTTCCCCAAATGCCAAAGAAAAGCCCTTGAGGAGAATTCCCCAAATCCATAGCGAGAAAGCTTTCATCTTGGATGCTTTGAGGAGAAGATTCGTGTTGAATGATAAGCCGAAAAGCAAACCCCGGAGGAATGTGAAGATAGTGAAAGCCGGTGGAGCTAAGGAGGTGAAGATCTCTAAAGCTGAGACCGATCCCGCCATTGATTTGGACGGGAAATCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809164.1
KWKKLFQLSICSFFSPNAKEKPLRRIPQIHSEKAFILDALRRRFVLNDKPKSKPRRNVKIVKAGGAKEVKISKAETDPAIDLDGKSDDPQMCGAYASDIYEYLHSMEIEAKRRPLSNYLEKIQKDVTANMRGVLIDWLVEVAEEYMLLLDTLYLIVSDIDKLLSCNALNRQKRQLLGVSSMDMPHCSNSGRCYTL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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