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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003881`

染色体: Chr04 坐标: 54663157-54665405 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003881`
名称	SmilChr04G003881
描述	protein BPS1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54663157 - 54665405 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020687`
GeneID	`131020687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020687`
原始查询	`SmilChr04G003881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein BPS1, chloroplastic-like
产物	protein BPS1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G46080` (BPS2) BPS1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819216] identity=54.9; qcov=0.997; evalue=2.8e-136; confidence=high
Rice	`Os10g0513300` - identity=48.8; qcov=0.789; evalue=1.04e-84; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05633 (ROH1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805655.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805654.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805654.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805654.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54664259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:54664308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C48
`Chr4:54664458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B22,C63,C77,C84
`Chr4:54664501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr4:54664653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B72
`Chr4:54664665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B9,C54,C83
`Chr4:54664749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:54664755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B72,C83
`Chr4:54664831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B35
`Chr4:54664831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:54664846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:54664932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B9,C54,C79,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805654.1

365 aa

182

365

ROH1-like

PF05633 ROH1-like 44-136 aa

XP_057805655.1

356 aa

178

356

ROH1-like

PF05633 ROH1-like 35-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805654.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	44	136	7.8e-13	48.9	Protein ROH1-like
`XP_057805655.1`	Pfam	`PF05633`	ROH1-like	Family	35	127	7e-13	49.1	Protein ROH1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949672.1
CGTGCCCCGTTTGTATTTGATAAATTCAATTCATTATCTCTTAATCGCCTCCCACTAATTTCCTCGAAATTTCATTCACCAATTTCTCTACGCGTCTCCGAGTACTGTTTCAGCCTTTCAGCTACGACTTCCCCTCCCTTCTCTCTTCTATAATCGGATTTAGTGCATCAAATGAGTCGCCCGCAGGATCCTCACAGAGGTTTCCTCCCATTCGGAAATCCATTCCGCATGATGCTACCAAAGGGATCCTCACTGTCACC...

XM_057949671.1
AATTTCCTCGAAATTTCATTCACCAATTTCTCTACGCGTCTCCGAGTACTGTTTCAGCCTTTCAGCTACGACTTCCCCTCCCTTCTCTCTTCTATAATCGGTATATATACGCTTACTTGTGTGCATCTATGTTTTGTTCGTGTTTTATTTTCATCGATTGTATAGTTTTTGAATTTTTTTAGCTTAATTTTGGAGGTGACTGCGAATTTGTCCGCTTTCACTGTTTTTTATAGGTGAAAGTATGATGAATTTGGATTTAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020687
ATGATGAATTTGGATTTAGTGCATCAAATGAGTCGCCCGCAGGATCCTCACAGAGGTTTCCTCCCATTCGGAAATCCATTCCGCATGATGCTACCAAAGGGATCCTCACTGTCACCGAAGATGCTCGATTTGTTAAATGCTTTCGAGGAAAGCATGGCGGAGAAGCTTAGAAAGCTTAAGCCTCCGGGCAAGGAAGATGTTCTGTGCTTGACATGGATGAAGAGTGCCATGGAGCTACTGTGTGAAATCCACGCTGACAT...

LOC131020687
ATGAGTCGCCCGCAGGATCCTCACAGAGGTTTCCTCCCATTCGGAAATCCATTCCGCATGATGCTACCAAAGGGATCCTCACTGTCACCGAAGATGCTCGATTTGTTAAATGCTTTCGAGGAAAGCATGGCGGAGAAGCTTAGAAAGCTTAAGCCTCCGGGCAAGGAAGATGTTCTGTGCTTGACATGGATGAAGAGTGCCATGGAGCTACTGTGTGAAATCCACGCTGACATAAAAGTTCTCATCACTGCTCTCGAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805654.1
MMNLDLVHQMSRPQDPHRGFLPFGNPFRMMLPKGSSLSPKMLDLLNAFEESMAEKLRKLKPPGKEDVLCLTWMKSAMELLCEIHADIKVLITALELPVCDWDDKWIDVYLDNSVKLLDICIALSSEISRLKQGHLFLRCLLHDLESASPKQFIQARSSLDGWRQHMGSKNPRLDNIFSVMDSLAQTLDLPKIKNSSKGKVLMRAMYGVKVVTLFICSVFAAAFSGSATKLMDLPVPETCLWAQAFSDLQTHVNNEIRNTN...

XP_057805655.1
MSRPQDPHRGFLPFGNPFRMMLPKGSSLSPKMLDLLNAFEESMAEKLRKLKPPGKEDVLCLTWMKSAMELLCEIHADIKVLITALELPVCDWDDKWIDVYLDNSVKLLDICIALSSEISRLKQGHLFLRCLLHDLESASPKQFIQARSSLDGWRQHMGSKNPRLDNIFSVMDSLAQTLDLPKIKNSSKGKVLMRAMYGVKVVTLFICSVFAAAFSGSATKLMDLPVPETCLWAQAFSDLQTHVNNEIRNTNPDKDKDKIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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