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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003887`

染色体: Chr04 坐标: 54684630-54688203 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003887`
名称	SmilChr04G003887
描述	protein REVEILLE 6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54684630 - 54688203 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020692`
GeneID	`131020692`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020692`
原始查询	`SmilChr04G003887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REVEILLE 6-like
产物	protein REVEILLE 6-like
Arabidopsis	`AT5G52660` (AT5G52660) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835343] identity=49.3; qcov=0.689; evalue=2.18e-58; confidence=high
Rice	`Os02g0680700` - identity=50; qcov=0.705; evalue=1.06e-72; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF24904 (RVE6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020692

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805659.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805663.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805659.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805659.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805659.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54685037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:54685081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C37
`Chr4:54685289`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A10,A6,A9,B101,B103,B107,B110,B115,B120,B128,B129,B137,B18,B2,B23,B49,B53,B6,B7,B75,B76,B79,B87,B93,C12,C17,C18,C19,C27,C29,C49,C55,C58,C69,C71,D4
`Chr4:54685302`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B41,D11
`Chr4:54685302`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr4:54685348`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B41,D11
`Chr4:54685348`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr4:54685349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	118	A13,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A5,A8,B1,B10,B101,B102,B107,B108,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B124,B125,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B137,B140,B15,B18,B19,B2,B21,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B4,B40,B44,B48,B49,B53,B54,B56,B57,B59,B61,B62,B63,B65,B68,B75,B77,B79,B84,B86,B90,B92,B93,B95,B96,B97,B98,C10,C11,C16,C17,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C35,C36,C38,C43,C45,C47,C48,C5,C50,C52,C53,C54,C58,C6,C64,C65,C66,C68,C69,C72,C73,C77,C79,C82,C83,C85,D10,D7,D9
`Chr4:54685352`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	54	A11,A14,A24,A7,B103,B105,B106,B11,B122,B128,B134,B138,B14,B24,B25,B27,B37,B38,B39,B41,B42,B51,B55,B58,B71,B74,B76,B78,B83,B87,B94,B99,C13,C18,C19,C26,C34,C37,C39,C40,C42,C46,C55,C61,C7,C70,C71,C8,C81,C84,C9,D1,D4,D6
`Chr4:54685373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B17,C39,C86
`Chr4:54686208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:54687123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C85,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805659.1

334 aa

167

334

Myb_DNA-binding

RVE6

PF00249 Myb_DNA-binding 69-114 aa PF24904 RVE6 247-305 aa

XP_057805660.1

325 aa

162

325

Myb_DNA-binding

RVE6

PF00249 Myb_DNA-binding 69-114 aa PF24904 RVE6 247-309 aa

XP_057805661.1

317 aa

158

317

Myb_DNA-binding

RVE6

PF00249 Myb_DNA-binding 69-114 aa PF24904 RVE6 247-302 aa

XP_057805663.1

315 aa

158

315

RVE6

PF24904 RVE6 237-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805659.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	69	114	1.2e-11	45.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805659.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	247	305	4.4e-32	110.8	REVEILLE 6-like domain
`XP_057805660.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	69	114	1.1e-11	45.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805660.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	247	309	3.6e-36	123.9	REVEILLE 6-like domain
`XP_057805661.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	69	114	1.1e-11	45.4	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805661.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	247	302	8.1e-32	109.9	REVEILLE 6-like domain
`XP_057805663.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	237	299	4.6e-36	123.5	REVEILLE 6-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100735.1
CATCTCTCCCCTCTCTCTCACCAAAAACCATACAAAAAACTCAACCCCCAAATTTTCATTTCCACCAACTCAAATTCAATCCGATTTTCCGAAACCAGAGCTTCGATTTCTCCTTCTACGCTCCACACGCGCTCTTCATATCTGCTTCTCCTTTGCTGTTTCAATTTTGGTTTCCGCGTCTGGGGCTGAGTTCGAAAGTGTTTGATCATACATGGTGTCGGTATACCGGAGTCCACCGCCGGATCAGGAATTTTCGCATT...

XM_057949677.1
CGGGACAGATCTCTTCCCTCTTCTCCCCCACACAAAGTCGGTTATTTTCCATAAACCCGTCGCTTTCCATCTCTCCCCTCTCTCTCACCAAAAACCATACAAAAAACTCAACCCCCAAATTTTCATTTCCACCAACTCAAATTCAATCCGATTTTCCGAAACCAGAGCTTCGATTTCTCCTTCTACGCTCCACACGCGCTCTTCATATCTGCTTCTCCTTTGCTGTTTCAATTTTGGTTTCCGCGTCTGGGGCTGAGTTC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020692
ATGGTGTCGGTATACCGGAGTCCACCGCCGGATCAGGAATTTTCGCATTTTCACGGTTTCTACGTGGGCGGTGATCCCTTGAAAATGCCGGAGGCGGATGGAGGTGACGGTAATCTGCTTCCGATGGCCACGGATGCGAATACGGCCTCGGGTGTGGATGATCCGAATAAGAAGATCCGAAAGCCGTACACGATCACGAAGTCCAGAGAGAGCTGGAGTGAGCAGGAGCATGATAAATTTCTCGAAGCGCTTCAGCTATT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805659.1
MVSVYRSPPPDQEFSHFHGFYVGGDPLKMPEADGGDGNLLPMATDANTASGVDDPNKKIRKPYTITKSRESWSEQEHDKFLEALQLFDRDWKKIEAFIGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTSEHVPPPRPKRKAAHPYPQKAAKNVVPRTGGPVQSSVAKVEAGYAVRRDPFSIPRNPINGSPLSSWSYNVVPAGCLSNVAKDDVGLASVAHNYSSSSNDSTPCGWKSNEMDHEVKAGQCNTARVMPDFAQVYGFIGSV...

XP_057805660.1
MVSVYRSPPPDQEFSHFHGFYVGGDPLKMPEADGGDGNLLPMATDANTASGVDDPNKKIRKPYTITKSRESWSEQEHDKFLEALQLFDRDWKKIEAFIGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTSEHVPPPRPKRKAAHPYPQKAAKNVVPRTGGPVQSSVAKVEAGYAVRRDPFSIPRNPINGSPLSSWSYNVVPAGCLSNVAKDDVGLASVAHNYSSSSNDSTPCGWKSNEMDHEVKAGQCNTARVMPDFAQVYGFIGSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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