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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003891`

染色体: Chr04 坐标: 54708529-54712465 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003891`
名称	SmilChr04G003891
描述	uncharacterized protein At1g01500
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54708529 - 54712465 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020700`
GeneID	`131020700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020700`
原始查询	`SmilChr04G003891`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Erythronate-4-phosphate dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839430]; symbol=AT1G01500; hit=AT1G01500; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Erythronate-4-phosphate dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839430]; symbol=AT1G01500; hit=AT1G01500; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G01500` (AT1G01500) Erythronate-4-phosphate dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839430] identity=59; qcov=0.954; evalue=1.77e-116; confidence=high
Rice	`Os03g0775600` - identity=41.9; qcov=0.99; evalue=2.01e-57; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30490 (At1g01500_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805670.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057805670.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805670.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805670.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805670.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54711666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B42,B43,B56,B96,C3
`Chr4:54711808`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr4:54711808`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr4:54711819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:54711891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,A22,B101,C43,C48
`Chr4:54711936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C83
`Chr4:54712104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805670.1

304 aa

152

304

At1g01500_N

PF30490 At1g01500_N 23-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805670.1`	Pfam	`PF30490`	At1g01500_N	Domain	23	187	2.9e-42	144.9	At1g01500-like N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949687.1
CGACGCGTGTGACCATCACGCTCCACTTGTCCTTGTGCCTCTCCCTTTTCTCCCTATTATTCTTTTTTCCTTTTCCATCTTCTCAATCTCAAATTACCCTCGGAAAAGAACCCTAAATTCCACAACAATTTGATTATTCCTGAATTCCCAAATGAGCCAAACACAGTGATTCTTATTCGAGAATTTCCAAATTAGATTGTTCGAAGCTTAGGGTTTTTTGGAGAATGGGCAAAAACGAGGACGATTTGCAGCTATCGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020700
ATGGGCAAAAACGAGGACGATTTGCAGCTATCGATTTACAGGCCGCCGATCTTCACCGGCGGGTGTTTGGAAATCCGCCTCTTCTACGTCCGAATCGCCCCCTGCGCGGTGGAGAACCTCCCGGACCAGCTGAAGCTCCGCCACCTCAGGCGGGAGGTGGGCGTCTCGTTCGAGATCAACGGCGCGCGCATCCCCTCGTCCGACGCCGTCTCCATCACTCTCCGCCGCGATCGCGTCAACAAGGACTCCTCCGAGGTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805670.1
MGKNEDDLQLSIYRPPIFTGGCLEIRLFYVRIAPCAVENLPDQLKLRHLRREVGVSFEINGARIPSSDAVSITLRRDRVNKDSSEVTYVSTDSVKISGPAEFEVCEERDDLDLILCGSLEKADAWSNESALDNDSKSGWSIECYAATPITNKSSALLQPRKGGCSPSIEVYVAGCCSGTPVILMKTVLVSPRRKARQGMMLDAIPEDEEMGKEQGNLCNGLVRQRKLQLMAADMDDEESEGKVAYSYYSEDMYPGEDGQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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