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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003897`

染色体: Chr04 坐标: 54765364-54766259 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003897`
名称	SmilChr04G003897
描述	RING-H2 finger protein ATL67-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54765364 - 54766259 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020769`
GeneID	`131020769`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020769`
原始查询	`SmilChr04G003897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-H2 finger protein ATL67-like
产物	RING-H2 finger protein ATL67-like
Arabidopsis	`AT3G61550` (AT3G61550) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825328] identity=52.9; qcov=0.99; evalue=8.66e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0736600` - identity=50.6; qcov=0.932; evalue=1.02e-44; confidence=medium
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0016740 (transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13639 (zf-RING_2); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020769

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057805760.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057805760.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057805760.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805760.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54765552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr4:54765577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B8,C84
`Chr4:54765634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B129,B60,B81,C10
`Chr4:54765655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54765720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr4:54765791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C13,C15,C56,C79
`Chr4:54765839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C13,C42
`Chr4:54765839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C42
`Chr4:54765855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr4:54765910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:54765964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:54765973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805760.1

191 aa

191

zf-RING_11

zf-RING_2

PF17123 zf-RING_11 122-150 aa PF13639 zf-RING_2 122-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805760.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	122	150	4.3e-07	30.2	RING-like zinc finger
`XP_057805760.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	122	164	9.3e-12	45.7	Ring finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949777.1
AAAATATTTTTTGTTGGAATTGAAAAATAAAATATACTATTGAATATGAAGAATCACCCCATGTTGTTGACCCATTAAATGAGTTCCTCTGTTTCCACATTCGAGTATTAAATGCTGCATCTATGCCCCCAACCCCCACCCACCCCCTCACTCAGATGGCATTTTCCACCCCCTTTCTCTCCAAATGTCCGCCTCGCCACCGCCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGTTAGCCCCCTCCCTCTCCAGAAACCTCACCTCGATCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020769
ATGTCCGCCTCGCCACCGCCTCCGCCTCCGCCGCCGCCGTTAGCCCCCTCCCTCTCCAGAAACCTCACCTCGATCGGCGCCATCTCCATCGCCCTCGGCTTCGTCGTCTTCTTCTCCATCCTCCTCCTCGCCTCCTACATCTGCTACCGATCCCTCTCCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGCGGAAATCCAAACCCTAGGAATTCCACGGAAAACAGCATCTATCTCCCGCGCATCATCTTCGTCGCCGAGGACGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805760.1
MSASPPPPPPPPPLAPSLSRNLTSIGAISIALGFVVFFSILLLASYICYRSLSRRRRRHGGGNPNPRNSTENSIYLPRIIFVAEDDEGENDAVVGLEQAVINSYPKLVFTKRSGNWENDAVCAICLCEYREAEMLRMLPDCRHCFHVMCVDAWLKLNASCPVCRNSPLPTPLSTPLQEVVPLSQYSDGRRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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