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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003906`

染色体: Chr04 坐标: 54815526-54818860 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003906`
名称	SmilChr04G003906
描述	UDP-D-xylose:L-fucose alpha-1,3-D-xylosyltransferase MGP4-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54815526 - 54818860 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020766`
GeneID	`131020766`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020766`
原始查询	`SmilChr04G003906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-D-xylose:L-fucose alpha-1,3-D-xylosyltransferase MGP4-like
产物	UDP-D-xylose:L-fucose alpha-1%2C3-D-xylosyltransferase MGP4-like
Arabidopsis	`AT4G01220` (MGP4) Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828028] identity=75.8; qcov=0.838; evalue=1.01e-179; confidence=high
Rice	`Os05g0386900` - identity=75.5; qcov=0.784; evalue=2.95e-163; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03407 (Nucleotid_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020766

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805756.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805756.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805756.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805756.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54815944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:54816027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:54816826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B74,C28
`Chr4:54816857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr4:54818487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805756.1

365 aa

182

365

Nucleotid_trans

PF03407 Nucleotid_trans 127-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805756.1`	Pfam	`PF03407`	Nucleotid_trans	Family	127	345	1.8e-45	156.2	Nucleotide-diphospho-sugar transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949773.1
GTGAAATGGGTAGTATGTAGTTCGATTTGGGCCGATCCATTTATCCCACCGTCGCAACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAGACACACACAGTTTGAGAATTCAATTGGATTTCTGCTGATTCAATTGAATTTGAGCTAACTTCAAATCCATAGGCAGTAATCACAATTGATGTCAAAGAAAATGTCAGCATTTCTGCATCAGAGGCCACTCTACTCCCCATCACCGGAATCTTACGATTTGTCCCCTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020766
ATGTCAAAGAAAATGTCAGCATTTCTGCATCAGAGGCCACTCTACTCCCCATCACCGGAATCTTACGATTTGTCCCCTAGATCCCGCGAAGATCACCAAAAAACCTCCGCCGCCGCCGCCTTCCTCAGCCGCGGCCCAGCATTGGTCGTCCTCCTCCTCTCGCTGCTCATAATCGTCGGCGTAGTGTTTCCCTACGTACAGTCCCCCAGTCCCCTCGTTTTCTTCACTACCAGGAGCTCCGATTCCAAGTGGCGGAGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805756.1
MSKKMSAFLHQRPLYSPSPESYDLSPRSREDHQKTSAAAAFLSRGPALVVLLLSLLIIVGVVFPYVQSPSPLVFFTTRSSDSKWRSYTLSDAAAYVAKNNSLIVCAVSEAYLSFLNNWLISITRQKHHEKVLVIAEDYATLFKVNERWPGHAVLVPPALEAAAPHKFGSQGFFNFTARRPQHLLQILELGYNVMYNDVDMVWLADPFPYLKGKHDVYFMDDMAYVKPLNHSHDLPPPGKKGRTYICSCLIYLRPTVGAKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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