当前解析结果
SmilChr04G003907| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003907 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003907 |
| 描述 | BAG family molecular chaperone regulator 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 54819756 - 54824337 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020763 |
|---|---|
| GeneID | 131020763 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020763 |
| 原始查询 | SmilChr04G003907 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BAG family molecular chaperone regulator 6 |
| 产物 | BAG family molecular chaperone regulator 6 |
| Arabidopsis | AT2G46240 (BAG6)BCL-2-associated athano 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819232] identity=28.4; qcov=0.464; evalue=2.93e-35; confidence=low |
| Rice | Os02g0259850- identity=31.2; qcov=0.278; evalue=2.67e-18; confidence=weak |
| GO | GO:0006457 (protein folding); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02179 (BAG) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020763 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057805754.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057805754.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057805754.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805754.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805754.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:54820886 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B29,B74,C28 |
Chr4:54820967 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A10 |
Chr4:54821042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B4 |
Chr4:54821079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B136,B19 |
Chr4:54821140 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B78,D4 |
Chr4:54821189 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B41,C12,D11 |
Chr4:54821476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B7,D8 |
Chr4:54821480 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B120,B37,C58 |
Chr4:54821480 |
G |
GC |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B120,B37,C58 |
Chr4:54821482 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B120,B37,C58 |
Chr4:54821536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr4:54821694 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,B81 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805754.1PF02179
BAG 524-598 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805754.1 |
Pfam | PF02179 |
BAG | Family | 524 | 598 | 4.5e-13 | 50.2 | BAG domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。