当前解析结果
SmilChr04G003914| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003914 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003914 |
| 描述 | NDR1/HIN1-like protein 6 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 54860983 - 54863021 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020776 |
|---|---|
| GeneID | 131020776 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020776 |
| 原始查询 | SmilChr04G003914 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NDR1/HIN1-like protein 6 |
| 产物 | NDR1/HIN1-like protein 6 |
| Arabidopsis | AT4G01110 (AT4G01110)late embryosis abundant hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827897] identity=35.5; qcov=0.98; evalue=7.47e-33; confidence=medium |
| Rice | Os01g0574800- identity=30.1; qcov=0.676; evalue=2.73e-11; confidence=low |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03168 (LEA_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020776 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057805774.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805774.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805774.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805774.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805774.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805774.1PF03168
LEA_2 127-222 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805774.1 |
Pfam | PF03168 |
LEA_2 | Domain | 127 | 222 | 7.7e-07 | 30.2 | Late embryogenesis abundant protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。