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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003917`

染色体: Chr04 坐标: 54874346-54875581 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003917`
名称	SmilChr04G003917
描述	pathogenesis-related genes transcriptional activator PTI6-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54874346 - 54875581 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020779`
GeneID	`131020779`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020779`
原始查询	`SmilChr04G003917`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related genes transcriptional activator PTI6-like
产物	pathogenesis-related genes transcriptional activator PTI6-like
Arabidopsis	`AT4G27950` (CRF4) cytokinin response factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828908] identity=48.5; qcov=0.606; evalue=9.75e-42; confidence=medium
Rice	`Os01g0224100` (OsERF#053) - identity=37.9; qcov=0.756; evalue=4.44e-25; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020779

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805780.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805780.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805780.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805780.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805780.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54874619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B89,C6
`Chr4:54874788`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	60	A11,A15,A19,A24,A3,A5,A9,B102,B104,B107,B113,B119,B12,B123,B124,B127,B134,B136,B138,B14,B18,B30,B32,B33,B34,B41,B49,B50,B51,B53,B59,B64,B66,B69,B72,B76,B80,B98,C1,C22,C28,C29,C30,C32,C46,C5,C50,C52,C54,C55,C56,C61,C63,C65,C68,C70,C72,C73,D2,D9
`Chr4:54874806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54874812`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr4:54874812`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr4:54874814`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A24,A8,B103,B105,B112,B12,B132,B135,B15,B16,B25,B29,B30,B37,B56,B60,B65,B71,B75,B79,B8,B96,C43,C49,C57,C62,C85
`Chr4:54874817`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A24,A8,B103,B105,B112,B12,B132,B135,B15,B16,B25,B29,B30,B37,B56,B60,B65,B71,B75,B79,B8,B96,C43,C49,C57,C62,C85
`Chr4:54874826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54874828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C68,C69,C73
`Chr4:54875002`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr4:54875002`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr4:54875005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805780.1

279 aa

140

279

AP2

PF00847 AP2 110-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805780.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	110	160	1.3e-15	58.1	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949797.1
CTTACTTTCCCATTTAATTGGGGATTCCTCTCAACTTTCGTGTTCCTTTCATTCCCACTCATATATTTACTCAATTCACCTAATATTTTTGCACTAAAATTTCACACAAATTCTTCTTCTAATTATCATTTTTCATGTGATGCGAGAAAATTAAGAAAAAAATATTTATTATGAAATCGAAAATCACAGAGCCGATCAAATACACTATCCACAAAACTCTCACAACCAAATTCTGCTCGCCGTCGCCGCCGTCGAGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020779
ATGAAATCGAAAATCACAGAGCCGATCAAATACACTATCCACAAAACTCTCACAACCAAATTCTGCTCGCCGTCGCCGCCGTCGAGCAAGCCATGCAGCCGCCGCGAAACGCCGCGTTTAGTCAGGATCTCCGTCACCGACTGCGACGCCACCGATTCATCCAACGACGAGCTTGAAAATCCATATTTCCGTCGAGTGAAAAAGCACGTAAACGAGGTTAGGTTTGAGAAGGAGAATTCTCTTACGATGAAAAGTGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805780.1
MKSKITEPIKYTIHKTLTTKFCSPSPPSSKPCSRRETPRLVRISVTDCDATDSSNDELENPYFRRVKKHVNEVRFEKENSLTMKSDAEEEEEKKKRRPPPATETERREKKFRGVRRRPWGRWAAEIRDPARHGARVWLGTYDTAEEAAMIYDAAAIQIRGANAVTNFTPPSTDAAAPAEDYGDACELVRFDFGDSKHDDAKLSCSRFESVDPKEEDLFSSDDFLSLGDEYMLNDDLDFRSQLICDEIRLREQVLDDDFSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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