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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003932`

染色体: Chr04 坐标: 54962216-54965584 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003932`
名称	SmilChr04G003932
描述	uncharacterized SmilChr04G003932
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54962216 - 54965584 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020795`
GeneID	`131020795`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020795`
原始查询	`SmilChr04G003932`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827924]; symbol=AT4G01040; hit=AT4G01040; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827924]; symbol=AT4G01040; hit=AT4G01040; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G01040` (AT4G01040) Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827924] identity=57.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0619800` - identity=59; qcov=0.321; evalue=1e-49; confidence=low
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0008061 (chitin binding); GO:0070492 (oligosaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF00704 (Glyco_hydro_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020795

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805801.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805801.1`
3	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805801.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805801.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54962323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,A18,B68,B85
`Chr4:54962401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:54962428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr4:54962538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B4
`Chr4:54962771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B78,C16,C33
`Chr4:54962907`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A20,B100,B107,B108,B118,B134,B29,B44,B49,B62,B64,B87,C34,C40,C71,C75,C8
`Chr4:54962910`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A20,B100,B107,B108,B118,B134,B29,B44,B49,B62,B64,B87,C34,C40,C71,C75,C8
`Chr4:54963028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B86
`Chr4:54963228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B77
`Chr4:54963417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B86
`Chr4:54965399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B58,B77,C4
`Chr4:54965414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805801.1

433 aa

216

433

Glyco_hydro_18

PF00704 Glyco_hydro_18 181-424 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805801.1`	Pfam	`PF00704`	Glyco_hydro_18	Domain	181	424	1.2e-15	58.7	Glycosyl hydrolases family 18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949818.1
AGACCAGTAAAAGCCCAATATCAACTTCCATTCCCAACCGGAGCGAAGACCGATCCGTGCGTGATTCGTTGTTTCATCGGCGTAGATGGCTAAAAAGCGAGAACGCCGCGCCGGAGCTCGCGCCGACGCCCAGTCTGAATCGTCTCAGACGGCCGGCGCCGAAAAATTCACTGAACCAGATCGCAGACGCATAACCACCGCGACGGTATTATTGCTCGTTGTAGTTCCTTTCGTTTCCGTAGTAGTATACCGTATACTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020795
ATGGCTAAAAAGCGAGAACGCCGCGCCGGAGCTCGCGCCGACGCCCAGTCTGAATCGTCTCAGACGGCCGGCGCCGAAAAATTCACTGAACCAGATCGCAGACGCATAACCACCGCGACGGTATTATTGCTCGTTGTAGTTCCTTTCGTTTCCGTAGTAGTATACCGTATACTGCACGCGCCGTCTCCGACTACCTCCGACCTATCGTATGTCTACCGCCGAGGCCTCGTTACTGAGAAAATTGACTACCGCCAAGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805801.1
MAKKRERRAGARADAQSESSQTAGAEKFTEPDRRRITTATVLLLVVVPFVSVVVYRILHAPSPTTSDLSYVYRRGLVTEKIDYRQVLQEHTMTSENSSRRNFENPVLAYITPWNSQGYEMAKKFSNKFTHLSPVWYELKSQGTKLVLEGRHNADKGWIADIKRTGNSQILPRVVLEATPLDLLKKKKQREKAIILIVAECKEMGYDGIVLESWSRWAAYGILHDPDMRITALQFVIQLGQAMHSVSLDQHKGQRLQLVYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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