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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003934`

染色体: Chr04 坐标: 54975636-54984071 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003934`
名称	SmilChr04G003934
描述	uncharacterized SmilChr04G003934
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54975636 - 54984071 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020796`
GeneID	`131020796`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020796`
原始查询	`SmilChr04G003934`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleotidyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825342]; symbol=AT3G61690; hit=AT3G61690; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nucleotidyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825342]; symbol=AT3G61690; hit=AT3G61690; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G61690` (AT3G61690) nucleotidyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825342] identity=50.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0114700` (OsNTP11) - identity=58.4; qcov=0.265; evalue=6.41e-136; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF22600 (MTPAP-like_central); PF26180 (PAP-OAS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020796

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805802.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805802.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057805802.1`
4	P-body	P-body	0.20000	`XP_057805802.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805802.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54976140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B4
`Chr4:54976841`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B124
`Chr4:54976841`	`GTT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B124
`Chr4:54977588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C77,C81
`Chr4:54977790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:54977850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr4:54977930`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr4:54977930`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr4:54978137`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	80	A10,A2,A20,A24,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B104,B107,B110,B111,B113,B114,B115,B121,B125,B129,B134,B135,B15,B16,B18,B2,B22,B24,B25,B28,B30,B39,B4,B40,B44,B47,B48,B55,B58,B62,B65,B66,B67,B76,B78,B79,B82,B9,B92,B93,B98,C1,C18,C2,C22,C29,C30,C32,C33,C38,C39,C40,C42,C47,C48,C55,C58,C59,C6,C61,C64,C68,C71,C73,C79,C80,D3,D4,D8,D9
`Chr4:54978142`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	77	A10,A2,A20,A24,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B104,B107,B110,B111,B113,B114,B115,B121,B125,B129,B134,B135,B15,B16,B18,B2,B22,B24,B25,B28,B30,B39,B4,B40,B44,B47,B48,B55,B58,B62,B65,B66,B76,B78,B79,B82,B9,B92,B93,B98,C1,C18,C2,C29,C32,C33,C38,C39,C40,C42,C47,C48,C55,C58,C59,C6,C61,C64,C68,C71,C73,C79,C80,D3,D4,D8,D9
`Chr4:54978144`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	79	A10,A2,A20,A24,A7,A8,A9,B1,B102,B103,B104,B107,B110,B111,B113,B114,B115,B121,B125,B129,B134,B135,B15,B16,B18,B2,B22,B24,B25,B28,B30,B39,B4,B40,B44,B47,B48,B55,B58,B62,B65,B66,B67,B76,B78,B79,B82,B92,B93,B98,C1,C18,C2,C29,C32,C33,C38,C39,C40,C41,C42,C47,C48,C55,C58,C59,C6,C61,C64,C66,C68,C71,C73,C79,C80,D3,D4,D8,D9
`Chr4:54978148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B110,B126,B30,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805802.1

1327 aa

664

1327

MTPAP-like_central

PAP-OAS1

PF22600 MTPAP-like_central 42-162 aa PF26180 PAP-OAS1 175-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805802.1`	Pfam	`PF22600`	MTPAP-like_central	Domain	42	162	5.6e-11	43.4	Poly(A) RNA polymerase, mitochondrial-like, central palm domain
`XP_057805802.1`	Pfam	`PF26180`	PAP-OAS1	Domain	175	367	1.8e-93	312.4	PAP/OAS1 substrate-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949819.1
TATGATATTGTTTGTGTAAAAAAGTTAGTAATATTTATTTTCTTTATTTCTATTTTCTCCCGCATAATCATTTTGCCAATTTCCATCCCTCATTTCCAGATACACACACTGAAACACGCACAAACACACATTCCTAATCAAATCAAAATCAAATCCGATTCCTCTTAACGTCAAGCAGAATTCAACGTTTTTCGCCAAGAATCCCAATTTCCACACCCACAAATTTAGGTCCCAACAGAAAAAGTAAATTCAATAAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020796
ATGGGAGAAAATGAAGGATGGGCAGAGCCAGGTGGGCCATCGCCGAATGGGCTTTTGCCAGGGGCAGGCCCTGTAATGCAGGCTGTCGATACAGAACGATGGTCCAGAGCAGAGGAGAGGACTGCAGAGCTCATTTCCTGCATTCAGCCCAACCATTTATCCGAGGAGCGGAGGAATGCGGTTGCCGAATATGTACAGAGGCTCATTATGAAGTGCTTTCCCTGCCAGGTCTGTACCTTTGGTTCTGTGCCATTGAAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805802.1
MGENEGWAEPGGPSPNGLLPGAGPVMQAVDTERWSRAEERTAELISCIQPNHLSEERRNAVAEYVQRLIMKCFPCQVCTFGSVPLKTYLPDGDIDLTAFSHDQTLKDTWANQVRDMLENEEKNENAEFHVKEVQYIQAEVKIIKCLVENIVVDISFNQVGGLCTLCFLDEVDSLINQNHLFKRSIILIKAWCYYESRILGAHHGLISTYALETLVLYIFHVFNNSFHGPLEVLYRFLEFFSNFDWDNFCVSLWGPVSISS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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