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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003941`

染色体: Chr04 坐标: 55016584-55019532 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003941`
名称	SmilChr04G003941
描述	putative RING-H2 finger protein ATL21A
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55016584 - 55019532 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023640`
GeneID	`131023640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023640`
原始查询	`SmilChr04G003941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative RING-H2 finger protein ATL21A
产物	putative RING-H2 finger protein ATL21A
Arabidopsis	`AT2G46495` (AT2G46495) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819259] identity=30.4; qcov=0.817; evalue=1.1e-16; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0030247 (polysaccharide binding)
KEGG	-
Pfam	PF13947 (GUB_WAK_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809169.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809169.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809169.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809169.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809169.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55016632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C21,C27,C32,C50
`Chr4:55016796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:55016816`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C21
`Chr4:55016816`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C21
`Chr4:55016886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:55016928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:55018924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:55018925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B84,C21,C52,D10
`Chr4:55018934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B26,B5,C82
`Chr4:55019147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr4:55019195`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A1,A10,A24,B1,B102,B104,B111,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B13,B130,B140,B17,B2,B29,B31,B48,B5,B51,B52,B6,B60,B61,B72,B85,B87,B94,C1,C11,C15,C17,C19,C22,C29,C32,C33,C39,C44,C56,C57,C6,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C76,C84,C87,D11,D9
`Chr4:55019407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809169.1

306 aa

153

306

GUB_WAK_bind

PF13947 GUB_WAK_bind 23-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809169.1`	Pfam	`PF13947`	GUB_WAK_bind	Domain	23	84	4.4e-11	43.7	Wall-associated receptor kinase galacturonan-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953186.1
ATGAGAATAATTCTTGCCATCTCATTCCTCTTTCTCACAACCTCGTCGTCATCAATCATCCACGCCTGTCCCAATTCAAACTGCGGCGACTTGTTCATCACTTATCCTTTCAAACTGCAGAACTCGACTGCCGAAAACGGCTGCAGCTACGTCGATCTGCGATGCAACGTGGCATCGCATGATTCGACCGTGATGAATCTCCCGAACGCGGGAGATTTCTACGTGCGTAACATCTCCTACGACTACGAGAATCCACACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023640
ATGAGAATAATTCTTGCCATCTCATTCCTCTTTCTCACAACCTCGTCGTCATCAATCATCCACGCCTGTCCCAATTCAAACTGCGGCGACTTGTTCATCACTTATCCTTTCAAACTGCAGAACTCGACTGCCGAAAACGGCTGCAGCTACGTCGATCTGCGATGCAACGTGGCATCGCATGATTCGACCGTGATGAATCTCCCGAACGCGGGAGATTTCTACGTGCGTAACATCTCCTACGACTACGAGAATCCACACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809169.1
MRIILAISFLFLTTSSSSIIHACPNSNCGDLFITYPFKLQNSTAENGCSYVDLRCNVASHDSTVMNLPNAGDFYVRNISYDYENPHIQLYDAGNCLVRRLISSSLSLSLASSPPLEALGAIYAVYTCPAAAVNTTRDALLYGIECLSNTTNVTVAVDIPPSMDLEAIGCQEIGSYYLPFPSSTNGFNGDLILTWDSASCPACAITEDNNSWNGFSGSPYFNLIFVVTVVVVTTASFLTTRKIIGRLNPNAAAAGGSAAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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