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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003947`

染色体: Chr04 坐标: 55060577-55062701 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003947`
名称	SmilChr04G003947
描述	uncharacterized SmilChr04G003947
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55060577 - 55062701 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020809`
GeneID	`131020809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020809`
原始查询	`SmilChr04G003947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat/KH domain protein (DUF1442) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819144]; symbol=AT2G45360; hit=AT2G45360; species=arabidopsis; confidence=low
产物	ankyrin repeat/KH domain protein (DUF1442) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819144]; symbol=AT2G45360; hit=AT2G45360; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G45360` (AT2G45360) ankyrin repeat/KH domain protein (DUF1442) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819144] identity=32.2; qcov=0.948; evalue=2.26e-25; confidence=low
Rice	`Os08g0110600` - identity=29.1; qcov=0.855; evalue=2.38e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07279 (DUF1442)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805822.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805822.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805822.1`
4	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057805822.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55060846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B45,C83
`Chr4:55060846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C83
`Chr4:55060960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr4:55060973`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr4:55060973`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr4:55061071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,B61,C73,D5
`Chr4:55061380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:55061386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr4:55061389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:55061409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805822.1

249 aa

124

249

DUF1442

PF07279 DUF1442 3-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805822.1`	Pfam	`PF07279`	DUF1442	Family	3	228	1.1e-28	100.8	Protein of unknown function (DUF1442)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949839.1
CTATTAGTATATTACTGGGAAAAAATAAAAACAAAAACCCTAGACTGATCCAACTTATTTTGCCTTTAGCAAAATTTCTGTTTTCAGGCACTCTTGCCATAAACTCCAACATAAAGAAATGGATTGGTCTCCAAAACATGCTACAAATGCATATCTTGATGCCCTAAAATTGTGTAGCACAACCAAGAAGCCTCGCAGCTCGCGCGCGCAGAAGCCCGAGAGCAACGAGTTCATATCAGCATTGGCAGCAGGGATGAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020809
ATGGATTGGTCTCCAAAACATGCTACAAATGCATATCTTGATGCCCTAAAATTGTGTAGCACAACCAAGAAGCCTCGCAGCTCGCGCGCGCAGAAGCCCGAGAGCAACGAGTTCATATCAGCATTGGCAGCAGGGATGAGCGCGAAGCTGATGGTGGAGGTGACATCGGAGGTGTCCCCATCGACGATAGCCCTAGCAGCAGCAGCTCGACAGACGGGGGGGAAGCTCGTGTGCATCCTCCCGGAGTCCGAGCTGCTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805822.1
MDWSPKHATNAYLDALKLCSTTKKPRSSRAQKPESNEFISALAAGMSAKLMVEVTSEVSPSTIALAAAARQTGGKLVCILPESELLTSQKRIEDSGLRDMVEFKTGDPAEVLLNYENVDFSLVDSKADDYDRLQETLDVNLKRSVVVTSNLLEGGKGLGGCLKGVEKTTRVRSMTHPIGKGMEVTMIGKSGGYRRSKSGGYTVDGGEGRKSKWISKVDQVSGEEHIYRMPRSQAAAAGAGAGQGAARLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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