当前解析结果
SmilChr04G003957| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003957 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003957 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003957 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 55108764 - 55111046 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020818 |
|---|---|
| GeneID | 131020818 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020818 |
| 原始查询 | SmilChr04G003957 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819266]; symbol=AT2G46540; hit=AT2G46540; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819266]; symbol=AT2G46540; hit=AT2G46540; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G46540 (AT2G46540)fiber [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819266] identity=82.8; qcov=0.985; evalue=7.42e-33; confidence=medium |
| Rice | Os05g0542100- identity=73.4; qcov=0.985; evalue=1.03e-29; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020818 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057805831.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057805831.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.80000 | XP_057805831.1 |
| 4 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.40000 | XP_057805831.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805831.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:55109885 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A20,B77 |
Chr4:55110765 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
Chr4:55110766 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B30 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。