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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003960`

染色体: Chr04 坐标: 55123651-55126970 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003960`
名称	SmilChr04G003960
描述	aluminum-activated malate transporter 10-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55123651 - 55126970 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020821`
GeneID	`131020821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020821`
原始查询	`SmilChr04G003960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aluminum-activated malate transporter 10-like
产物	aluminum-activated malate transporter 10-like
Arabidopsis	`AT4G00910` (AT4G00910) aluminum activated malate transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827985] identity=48.9; qcov=0.977; evalue=4.94e-152; confidence=high
Rice	`Os02g0673100` (OsALMT7) - identity=42; qcov=0.969; evalue=3.05e-117; confidence=medium
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015743 (malate transport)
KEGG	-
Pfam	PF11744 (ALMT); PF13515 (FUSC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805839.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805839.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805839.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805839.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55123898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:55123915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B64
`Chr4:55124096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:55124508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr4:55124525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B64
`Chr4:55124535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B136,B20,B35
`Chr4:55124540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C42
`Chr4:55124585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B81,C46
`Chr4:55124639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr4:55124852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B104,B78,B94,D10
`Chr4:55124856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:55124861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805839.1

477 aa

238

477

ALMT

FUSC_2

PF11744 ALMT 69-413 aa PF13515 FUSC_2 95-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805839.1`	Pfam	`PF11744`	ALMT	Family	69	413	3e-134	449.2	Aluminium activated malate transporter
`XP_057805839.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	95	231	9.6e-07	29.7	Fusaric acid resistance protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949856.1
TACTCGACTACCAACTGATACCAGCAAACTAGCCAAAGACACAATCTCTGATTGTGAAAGCTTGCTACTCTTTAATTCTTCCAACCATGTATAAGTATACGTATCATATCGTGGAAACGAATATTCCATACCTCAGAGATCCACCCATGGCCAAGGAGGGCGAGGCGTGGGAATGGAGGATGAGCTTCCCGGATGGCATGTCAAAGCTCTTCGTCTCCGAGTGCATGCCTCAGGCCCCTGGCCTCGTCGTGGGGCTGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020821
ATGTATAAGTATACGTATCATATCGTGGAAACGAATATTCCATACCTCAGAGATCCACCCATGGCCAAGGAGGGCGAGGCGTGGGAATGGAGGATGAGCTTCCCGGATGGCATGTCAAAGCTCTTCGTCTCCGAGTGCATGCCTCAGGCCCCTGGCCTCGTCGTGGGGCTGTCGTTGAGGTGTTGGGGGTTGATGCAGACTGGCTGGAGGTATGGGATGAGCGAGCCTCAGAAGGTCATCCATTGCTTCAAAGTCGGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805839.1
MYKYTYHIVETNIPYLRDPPMAKEGEAWEWRMSFPDGMSKLFVSECMPQAPGLVVGLSLRCWGLMQTGWRYGMSEPQKVIHCFKVGMALCLVSLFYYVSPLYEGVGGNAMWAVLTVVVAFEYTVGATICKCLNRTTATFLAGALGIGVHWVATRFGATSEPIILQASVFVIASAATFLRFLPSVKAHFDHGALIFIFTFILVSISGYRVPDLFEFTHHRVSTVAIGTSICVVTSIFCCPVWAGNELHSLIQSNMEKLADS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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