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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003966`

染色体: Chr04 坐标: 55143242-55145882 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003966`
名称	SmilChr04G003966
描述	AAA-ATPase At2g46620
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55143242 - 55145882 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020827`
GeneID	`131020827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020827`
原始查询	`SmilChr04G003966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase At2g46620
产物	AAA-ATPase At2g46620
Arabidopsis	`AT2G46620` (AT2G46620) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819274] identity=53.7; qcov=1.02; evalue=1.3e-178; confidence=high
Rice	`Os03g0114400` (OSJNBa0090O10.13) - identity=41.6; qcov=1.03; evalue=2.47e-129; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF14363 (AAA_assoc); PF25568 (AAA_lid_At3g28540)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057805851.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057805851.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057805851.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057805851.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057805851.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55143616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:55143666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B103,B78
`Chr4:55143786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55144050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B41,C61
`Chr4:55144107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B103,B78
`Chr4:55144120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:55144193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C4,C62
`Chr4:55144401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr4:55144494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B51
`Chr4:55144505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:55144818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805851.1

476 aa

238

476

AAA_assoc

AAA

AAA_lid_At3g28540

PF14363 AAA_assoc 44-118 aa PF00004 AAA 227-344 aa PF25568 AAA_lid_At3g28540 346-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805851.1`	Pfam	`PF14363`	AAA_assoc	Family	44	118	1.2e-08	36.0	Domain associated at C-terminal with AAA
`XP_057805851.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	227	344	4.4e-19	69.9	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057805851.1`	Pfam	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	Domain	346	412	2.4e-12	47.3	At3g28540-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949868.1
TTTTTCTCTAAAATTCTCAGCTAGTTGTTCTACGAATGGGGATACAAATAATTAAAAAAAGAGTAATTTTTCAATTTATATATATACAAATATTCTTTTTATAACAAAATTGGGATTGTTCTATACTAATTCCGCCCTTACCCGCACTCTAATCATTCAATTGAGTGGTTATTATTTCTAAAATTGGCTGATTTATTTAAAATATTTTTTATATATTACTATTAAAGTTCTAATAAAATAATCACCTCATTCAAAAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020827
ATGTTTGTTGCGAATCTGGTGTTGATATGCTTCGCGATTGCGTGCTCGATTTTTCTGGTGCGGTGGTTCCTGCACCGGACCGCTCTCATCTACGGCGTCAGGAAAGGGGTGGAGTGGGTGGGAGACCGAGTTCACGTGCACCAGCACTTCAAGGTCCCCGAGTTGAACGATTCGACTCAGCAGCAGAACCTGTTCTACCGCCGAGTTTCGCTCTACCTGAGTTCGCTGCCTTCGTTAGAGGACTCCGATTTTACCAACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805851.1
MFVANLVLICFAIACSIFLVRWFLHRTALIYGVRKGVEWVGDRVHVHQHFKVPELNDSTQQQNLFYRRVSLYLSSLPSLEDSDFTNLFTGRKANDIVLSLDDNQAIQDVFLGARISWLNRVERDRGNQIVCRSFVLRIKKKDKRRILKPYLQHIHAVSDDIEERGAELKIYNHCDGRWKSVLFNHPASFDSLVLDPDLKTKIRHDLETFLKSKQYYHKLGRVWKRSYLLYGPSGTGKSSFVAAAANLLNYDVYYVNLSQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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