当前解析结果
SmilChr04G003969| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003969 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003969 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003969 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 55162182 - 55165674 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020830 |
|---|---|
| GeneID | 131020830 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020830 |
| 原始查询 | SmilChr04G003969 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020830 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805853.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805853.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805853.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805853.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057805853.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:55162375 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B118,B31,B54,B57,C63 |
Chr4:55162390 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr4:55162402 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | B10,B103,B126,B15,B17,B30,B79,B83,B94,B95,B99,C27,C44,C6 |
Chr4:55162403 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B61,B64,B65,C34,C45 |
Chr4:55162463 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B61,B64,B65,C45 |
Chr4:55162466 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A14,B112,B53,B62,C84 |
Chr4:55162466 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A14,B112,B53,B62,C84 |
Chr4:55162490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B117,B130 |
Chr4:55162496 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B111,B92 |
Chr4:55162502 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B105,B110,B118,B80,C27 |
Chr4:55162502 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B110,B118,B80,C27 |
Chr4:55162505 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | A2,B119,B36,B40,B75,C53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。