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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003973`

染色体: Chr04 坐标: 55199595-55201198 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003973`
名称	SmilChr04G003973
描述	homeobox-leucine zipper protein ATHB-12
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55199595 - 55201198 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020835`
GeneID	`131020835`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020835`
原始查询	`SmilChr04G003973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein ATHB-12
产物	homeobox-leucine zipper protein ATHB-12
Arabidopsis	`AT3G61890` (HB-12) homeobox 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825362] identity=44.1; qcov=1.15; evalue=4.84e-42; confidence=medium
Rice	`Os09g0528200` (Oshox6) - identity=56.5; qcov=0.65; evalue=1.02e-37; confidence=medium
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020835

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805857.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805857.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805857.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805857.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55199978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B119,C3,C86
`Chr4:55200753`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B100
`Chr4:55200753`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B100
`Chr4:55200950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B94,C20,C49,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805857.1

177 aa

177

Homeodomain

HALZ

PF00046 Homeodomain 7-61 aa PF02183 HALZ 63-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805857.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	7	61	1.4e-17	64.0	Homeodomain
`XP_057805857.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	63	103	4.9e-13	49.7	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949874.1
ATAATTACATATGCAATGCACCTGCAGCAGTATAAAATTTAATGTAGGAAGTAGAAGAAAAGCTGTACACGGCTTGGGAGGGGCGCAGGCCCACCGCGGCACCTCCGCCCATATAAAATCAGACGCACGCACATGCCATTTTTCAAAAACCCTCCCAATTAGAAGAAAACTGCAGGCAGCCACACATTCCTTGATGCGGAAAGTAATCATCAATCAGCGATGAAGAAGATGAGCCGGAGCGACAAGCGCCGATTCAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020835
ATGAAGAAGATGAGCCGGAGCGACAAGCGCCGATTCAGCGACGAGCAAATCCGGCGGCTGGAGGTGATCTTCGAGGCGGAGAGCAAGCTGGAGGCGAGGAAGAAGGCGGAGGTGGCGCGGGAGCTGGGGCTGCAGCCGCGCCAGGTCGCGATTTGGTTCCAGAATCGGCGAGCTCGGTGGAAATCGAAGCACATTGAGAAGGAATACGCCGCCTTGCTCGCTAATTACAACGCCCTCGCCGCCGAGTTCGACTCGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805857.1
MKKMSRSDKRRFSDEQIRRLEVIFEAESKLEARKKAEVARELGLQPRQVAIWFQNRRARWKSKHIEKEYAALLANYNALAAEFDSLKKEKHSLLNQLEKLKGKGDDDEEGGSGARCGGESESVKTNDFEVKNEGMVSVSDEEEMLRMVETTSDWGGLDCDDIIIDQSSSYQWWGFWS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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