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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003975`

染色体: Chr04 坐标: 55221383-55223023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003975`
名称	SmilChr04G003975
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 27
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55221383 - 55223023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020838`
GeneID	`131020838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020838`
原始查询	`SmilChr04G003975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 27
产物	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 27
Arabidopsis	`AT2G01850` (EXGT-A3) endoxyloglucan transferase A3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814716] identity=45.9; qcov=0.951; evalue=7.69e-93; confidence=high
Rice	`Os03g0239000` (OsXTH28) - identity=46.7; qcov=0.886; evalue=3.11e-89; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005618 (cell wall); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	-
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16); PF06955 (XET_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057805858.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057805858.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805858.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805858.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55221686`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr4:55221686`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B55
`Chr4:55221718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:55221734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B118,B44,C23,C83
`Chr4:55221737`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B126,B41,B86,C54,C64,C66
`Chr4:55221783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr4:55221786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C19,C47
`Chr4:55221791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:55221792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B89,C72
`Chr4:55221798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr4:55221825`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr4:55221825`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B106

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805858.1

307 aa

154

307

Glyco_hydro_16

XET_C

PF00722 Glyco_hydro_16 32-215 aa PF06955 XET_C 247-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805858.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	32	215	8.9e-49	166.0	Glycosyl hydrolases family 16
`XP_057805858.1`	Pfam	`PF06955`	XET_C	Family	247	282	1.8e-11	44.3	Xyloglucan endo-transglycosylase (XET) C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949875.1
CAAAAACAAGTACACCCTCATTAATTTATATATACACACGATTAAAACACGCTCCCAAATTCAAGATTAATATATATATATACACATAATCCCTCCCAACATTTTCAACAACTGCACTAGAAATTCGAGAAAATACCAAAAAATGGTCGGATTTTTGGGTGCAGTTGTGGCTGCTGCTATTGTGCTCATCTCCACTAGTAGCATCGTCTTGGTCGAATCTTCGATAACCACATTCAGCAAAGCGTTCAAGCCCTTATACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020838
ATGGTCGGATTTTTGGGTGCAGTTGTGGCTGCTGCTATTGTGCTCATCTCCACTAGTAGCATCGTCTTGGTCGAATCTTCGATAACCACATTCAGCAAAGCGTTCAAGCCCTTATACGGGGAGTCGAACATCGTGTCGTACGAGGACGAGGGCTCCGTCGAGATCGCCATGGACGAGGCCACGAGCTCCGGCTTCCACTCGAAGGAAATGTACGTGCAGGGATACTTCGAGACGTCGCTGAGGCTGCCGGAGAGCTACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805858.1
MVGFLGAVVAAAIVLISTSSIVLVESSITTFSKAFKPLYGESNIVSYEDEGSVEIAMDEATSSGFHSKEMYVQGYFETSLRLPESYTAGVVVTFYASNNQKYPYRHDEIDLEFLGRARGGTWSLQTNFYGGGHVERGREERYDLWFDPSEDSHRYAIRWGPDRITYYVDGVPIRHVAKAPAMRAEFPNKEMRLYGTIWNGSDWATGGGRYKMDMSYGPFVAKYSGFVMNGCPFNGTGPRDCVDRGLTLTREERLKMNGFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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