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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003976`

染色体: Chr04 坐标: 55224294-55227594 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003976`
名称	SmilChr04G003976
描述	GRF1-interacting factor 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55224294 - 55227594 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020839`
GeneID	`131020839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020839`
原始查询	`SmilChr04G003976`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRF1-interacting factor 3-like
产物	GRF1-interacting factor 3-like
Arabidopsis	`AT4G00850` (GIF3) GRF1-interacting factor 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827995] identity=55.1; qcov=1.06; evalue=3.51e-53; confidence=high
Rice	`Os12g0496900` - identity=67; qcov=0.472; evalue=9.42e-34; confidence=medium
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0008283 (cell population proliferation); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0048366 (leaf development)
KEGG	-
Pfam	PF05030 (SSXT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805859.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057805859.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805859.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805859.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805859.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55224601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,D10,D11
`Chr4:55224669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B64,C4,C62
`Chr4:55224692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B60,C80
`Chr4:55224693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55224728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B89,B98,C72
`Chr4:55224809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C79,D10
`Chr4:55224827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55224878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr4:55227052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805859.1

212 aa

106

212

SSXT

PF05030 SSXT 18-74 aa

XP_057805860.1

212 aa

106

212

SSXT

PF05030 SSXT 18-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805859.1`	Pfam	`PF05030`	SSXT	Family	18	74	3.5e-22	78.4	SSXT protein (N-terminal region)
`XP_057805860.1`	Pfam	`PF05030`	SSXT	Family	18	74	3.5e-22	78.4	SSXT protein (N-terminal region)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949877.1
TGTATTAAAATTAATAAATTAATAGGTATGTGAGTCACAATTCACAAATTCCTCAAGAAAAAAGCTCAACTCCACTTCGCCTGCACCAACCTCATAAATCCACTCCACCGCCAATTTGAAGTTTTAACAGCCTCAGTTTCCACTATTTCAATTCAACTGTTTCAGCTGCTCCACTGCGTTTAATTTCTACCGATTATTCGATATTTCAATTAAAAAACTAATCTTTCGCCAAACCCCAGTCTAATTGTACGATACAACCA...

XM_057949876.1
GTGAGTCACAATTCACAAATTCCTCAAGAAAAAAGCTCAACTCCACTTCGCCTGCACCAACCTCATAAATCCACTCCACCGCCAATTTGAAGTTTTAACAGCCTCAGTTTCCACTATTTCAATTCAACTGTTTCAGCTGCTCCACTGCGTTTAATTTCTACCGATTATTCGATATTTCAATTAAAAAACTAATCTTTCGCCAAACCCCAGTCTAATTGTACGATACAACCAGCAGGAGAGAGGTAGTGAAGATGCAGCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020839
ATGCAGCAACCGGGGCCAATGTTTCCTGTCATGCCGTCGTTTCCACCTACGAATATCACCACCGAGCAGATTCAGAAGTACCTGGATGAGAACAAGAAATTGATATTGGCTATTCTGGATAATCAAAATCTAGGCAAACTCGCTGAATGTGCCCAGTACCAGGCTCAACTTCAAAAGAACCTCATGTATTTGGCTGCTATAGCTGATGCCCAACCACAAACACCAGCAATGCCTAGCCAGATGACTCCCCATCCCGCGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805859.1
MQQPGPMFPVMPSFPPTNITTEQIQKYLDENKKLILAILDNQNLGKLAECAQYQAQLQKNLMYLAAIADAQPQTPAMPSQMTPHPAMQQGGFYMQHPQAAAAMAQQQGMFQPRAPFNSPHLLQDPQQQHGHPQAGQGQLGMRSVGPNNGMNPQHNDASLGGASSSVPTSNSNLNDIRGVSKQDKPDSRAATGSDGQGNSAAARGGGDAEEAK

XP_057805860.1
MQQPGPMFPVMPSFPPTNITTEQIQKYLDENKKLILAILDNQNLGKLAECAQYQAQLQKNLMYLAAIADAQPQTPAMPSQMTPHPAMQQGGFYMQHPQAAAAMAQQQGMFQPRAPFNSPHLLQDPQQQHGHPQAGQGQLGMRSVGPNNGMNPQHNDASLGGASSSVPTSNSNLNDIRGVSKQDKPDSRAATGSDGQGNSAAARGGGDAEEAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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