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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003977`

染色体: Chr04 坐标: 55229652-55231332 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003977`
名称	SmilChr04G003977
描述	NAC domain-containing protein 43-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55229652 - 55231332 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020840`
GeneID	`131020840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020840`
原始查询	`SmilChr04G003977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 43-like
产物	NAC domain-containing protein 43-like
Arabidopsis	`AT2G46770` (NST1) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819290] identity=50.4; qcov=0.977; evalue=1.28e-114; confidence=high
Rice	`Os08g0115800` (ONAC029) - identity=48.6; qcov=1.01; evalue=5.21e-104; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805861.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805861.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805861.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805861.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55229974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C77,C81
`Chr4:55229975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:55230051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C19
`Chr4:55230162`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B90,B92
`Chr4:55230333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B134,B135
`Chr4:55230447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,D3
`Chr4:55230453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,C43,C54
`Chr4:55230469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B21,B94,C2
`Chr4:55230648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:55230659`	`TA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B121,B7
`Chr4:55230661`	`TTA`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B104,B121,B7
`Chr4:55230714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805861.1

394 aa

197

394

NAM

PF02365 NAM 12-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805861.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	12	139	4.6e-46	157.0	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949878.1
CAGCCACAGCCGCGGTGGCGCCCACCCCCCCACCCCACCCCACCCCACCCCCACCACCACCCCCAACTAGGTAGCTTCATCCATTCATGGCCCCACCTCAGCTTATAAGTTATAATTCCATGCACAAGATTTTGTTGTGAAGCAAACGATGAGCATATCGGTGAACGGGCAGTCGCAGGTGCCGCCGGGGTTCCGATTTCACCCGACGGAGGAGGAGCTGCTGCAGTATTACTTGAAGAAGAAGGTTGTCTCGGAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020840
ATGAGCATATCGGTGAACGGGCAGTCGCAGGTGCCGCCGGGGTTCCGATTTCACCCGACGGAGGAGGAGCTGCTGCAGTATTACTTGAAGAAGAAGGTTGTCTCGGAGAAGATTGATTTGGATGTCATCCAAGATGTGGATCTCAACAAACTCGAGCCTTGGGATATTCAAGAAAAGTGCAGAATAGGGACGACCCCGCAGAACGATTGGTACTTCTTCAGCCACAAGGACAAGAAGTACCCGACGGGGACGAGGACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805861.1
MSISVNGQSQVPPGFRFHPTEEELLQYYLKKKVVSEKIDLDVIQDVDLNKLEPWDIQEKCRIGTTPQNDWYFFSHKDKKYPTGTRTNRATCSGFWKATGRDKVIYGNSTRIGMRKTLVFYKGRAPHGQKSDWIMHEYRLDDNATPNNIAAASVCNGAGEGGQEEGWVVCRVFKKKSLGHKASDCSPIGATWPSPTSMSTMNSCNEASLEEMLQSMGTPSRRDFDTDNNNDNNNNNNNNNDNNNSCNRRYMKLPGLYNSSC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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