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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003981`

染色体: Chr04 坐标: 55256516-55259156 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003981`
名称	SmilChr04G003981
描述	probably inactive receptor-like protein kinase At2g46850
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55256516 - 55259156 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020846`
GeneID	`131020846`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020846`
原始查询	`SmilChr04G003981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probably inactive receptor-like protein kinase At2g46850
产物	probably inactive receptor-like protein kinase At2g46850
Arabidopsis	`AT2G46850` (AT2G46850) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819298] identity=48.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0351500` - identity=36.6; qcov=1.04; evalue=1.54e-100; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007166 (cell surface receptor signaling pathway)
KEGG	-
Pfam	PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020846

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805873.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805873.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805873.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805873.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805873.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55256744`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A3,A5,B17,B31,C66
`Chr4:55256744`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A3,A5,B17,B31,C66
`Chr4:55257009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B94,C2
`Chr4:55257032`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr4:55257032`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr4:55257045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55257115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,D10
`Chr4:55257303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B66,C23,C37,D9
`Chr4:55257399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55257411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C73
`Chr4:55257709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C73
`Chr4:55257736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805873.1

614 aa

307

614

PK_Tyr_Ser-Thr

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 345-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805873.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	345	477	1.1e-09	38.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949890.1
TTTGATAGTAATAAGAGAAGAGAGGCGAAAAATCCAATTGGCGGGCGTGTTTCCAAGTCCCAATTTCCGCGACGCACGGGATTAGCACAGTTGCATAGGTACGACTGCGTCCCATTCCTGAGACCAACCGTCTCCCCTTCCCTCACTCCAACACTACACCTTTCCTCCATTTCCCCTCTCCCTCTCTCCCTCACTTCCCCACCCATGCCATGTCACCGTCGTCGATCCTCTTCCTCCTCCACGCCCCCCTCCTCCTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020846
ATGTCACCGTCGTCGATCCTCTTCCTCCTCCACGCCCCCCTCCTCCTCGCCTCCGCATGCGGCCCCTCCGCCATCCCCTTCCCCTTCCACCTCTCCCCCGCCTCCCCCGCCCCCGCCGCCTTCCGCCTCTCCTGCCTCAACTCCTCCTCCCTCTTCCTCACCCTCGCCTCCCGCTCCTACCGCGTCCTCCGCTTCCTCCCCGACGGCCTCCTCCTCGACTTCCCCAACGCCTCCCTCTGCCGCCACTACAACGACCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805873.1
MSPSSILFLLHAPLLLASACGPSAIPFPFHLSPASPAPAAFRLSCLNSSSLFLTLASRSYRVLRFLPDGLLLDFPNASLCRHYNDLRSFPFAADQYLAVSADNVLDLYGCDDSSLCKPECERTSSMPSCDGRAAAAYPSCCYPLSDRGAWRPADGLAAFSRYGCRGFSSWVVVPGSAVGIRGVKLEWALPRNSTAAPACAANANVVNATSVANGFRCRCVDGFSGDGFPAGVGCIKSCFKDGKEVHGNECYEVKHGRKKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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