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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003987`

染色体: Chr04 坐标: 55296037-55297756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003987`
名称	SmilChr04G003987
描述	uncharacterized SmilChr04G003987
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55296037 - 55297756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020854`
GeneID	`131020854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020854`
原始查询	`SmilChr04G003987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829979]; symbol=AT4G38225; hit=AT4G38225; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glycerol kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829979]; symbol=AT4G38225; hit=AT4G38225; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G38225` (AT4G38225) glycerol kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829979] identity=51.1; qcov=0.93; evalue=4.18e-106; confidence=high
Rice	`Os03g0128800` - identity=53.9; qcov=0.824; evalue=2.59e-94; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805882.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057805882.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805882.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805882.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805882.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55296234`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A1,A18,B111,B114,B118,B12,B120,B135,B26,B27,B30,B36,B47,B5,B53,B56,B57,B8,B85,B91,B96,B97,C45,C51,C55,C57,C73,C78,C80,C81,D3,D4,D6,D8
`Chr4:55296253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr4:55296353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A5,B128,B129,B16,B2,B35,B62,B87,B88,B9,C1,C13,C28,C35,C39,C79
`Chr4:55296416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B33,B78,B85,C46
`Chr4:55296431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:55296445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr4:55296696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55296705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:55296753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,A24,C47
`Chr4:55296868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C79
`Chr4:55297074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:55297117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B16,B60,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949899.1
ATTCATGGGACATATAATCATTACCGCTACTCTCCATAATGCTTGTCGCTTTTGTCCCCAATCATCAACGAGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGAGGATTGATGTGCAACACTTGCATATTTTGGTAAATCAAAACAATCTGGACATGTGAGAGAGAGAGAGGAGAGGGAGGGGGAGAAATTTACCAAAATAGCATGGCCATGACGGCAGCAATCTTCTCCTCCAACACCAATATCCTCTCACCTCCTCCGCAGCGCC...

XM_057949900.1
ATTCATGGGACATATAATCATTACCGCTACTCTCCATAATGCTTGTCGCTTTTGTCCCCAATCATCAACGAGTGGTGGTGGTGGCGGCGGCGGCGGAGGATTGATGTGCAACACTTGCATATTTTGGTAAATCAAAACAATCTGGACATGTGAGAGAGAGAGAGGAGAGGGAGGGGGAGAAATTTACCAAAATAGCATGGCCATGACGGCAGCAATCTTCTCCTCCAACACCAATATCCTCTCACCTCCTCCGCAGCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020854
ATGGCCATGACGGCAGCAATCTTCTCCTCCAACACCAATATCCTCTCACCTCCTCCGCAGCGCCACCCGCCCCTCCGCTCCTCTTCCGCCCTCCAATTTCCTGTTAAATATAGCACGCAGCAATTCCGTTATAGTTCTAATTATAGCTCGCCTGCTGCTCCAATTCTCAGCTGCGTCTCCGCCGCTGCCGCCGAAGCCGCCACCACCACCGCCGACGACCTCGATTCCGCTTCGATTTCGACAACCAGCAGCTGGGTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805882.1
MAMTAAIFSSNTNILSPPPQRHPPLRSSSALQFPVKYSTQQFRYSSNYSSPAAPILSCVSAAAAEAATTTADDLDSASISTTSSWVEFAEKVSGEWDGFGADFTAEGQAVELPESVVPEAYREWEVKVFDWQTQCPTLAETLGSSPSLTYRSIKLLPTVGCEADAATVYTSEERNISDASAFAYASTGCYVAERRIDSAAKSVELEYCLIDPTNKESRVRVIQVLNLQESEPKLARIKVFVEQWYGPFRNGDQLGGCAIR...

XP_057805883.1
MAMTAAIFSSNTNILSPPPQRHPPLRSSSALQFPVKYSTQQFRYSSNYSSPAAPILSCVSAAAAEAATTTADDLDSASISTTSSWVEFAEKVSGEWDGFGADFTAEGQAVELPESVVPEAYREWEVKVFDWQTQCPTLAETLGSSPSLTYRSIKLLPTVGCEADAATVYTSEERNISDASAFAYASTGCYVAERRIDSAAKSVELEYCLIDPTNKESRVRVIQVLNLQESEPKLARIKVFVEQWYGPFRNGDQLGGCAIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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