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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003993`

染色体: Chr04 坐标: 55322568-55324194 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003993`
名称	SmilChr04G003993
描述	protein EXORDIUM-like 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55322568 - 55324194 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020860`
GeneID	`131020860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020860`
原始查询	`SmilChr04G003993`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EXORDIUM-like 5
产物	protein EXORDIUM-like 5
Arabidopsis	`AT2G17230` (EXL5) EXORDIUM like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816228] identity=70.8; qcov=0.965; evalue=1.05e-169; confidence=high
Rice	`Os06g0133600` (134P10.10) - identity=60.6; qcov=0.922; evalue=1.07e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04674 (Phi_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057805889.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805889.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805889.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805889.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805889.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55322977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B45,B64,C32,C68
`Chr4:55323013`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	181	A11,A13,A14,A15,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B23,B24,B25,B27,B3,B30,B35,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B49,B50,B51,B52,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B67,B71,B73,B74,B75,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,C1,C10,C12,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C36,C37,C4,C40,C41,C42,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr4:55323016`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	181	A11,A13,A14,A15,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B121,B122,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B23,B24,B25,B27,B3,B30,B35,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B49,B50,B51,B52,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B67,B71,B73,B74,B75,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,C1,C10,C12,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C32,C33,C36,C37,C4,C40,C41,C42,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C73,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C87,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr4:55323230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55323250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B115,B37,B59,C8
`Chr4:55323264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:55323266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55323325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55323334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:55323417`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B132
`Chr4:55323417`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B132
`Chr4:55323466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805889.1

347 aa

174

347

Phi_1

PF04674 Phi_1 64-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805889.1`	Pfam	`PF04674`	Phi_1	Family	64	342	1.5e-101	340.2	Phosphate-induced protein 1 conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949906.1
AAGCAGTCAGTTAGGTGAAAGTTTGAAATTTGGTTTCGTTATTCCCGTAGCATTAAAGTGGGCATCCATCACTGCTCGTAACTCCTTGTTTCGCTAATTTCCAGATTCCATGTAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAGTGCCCACCAGCACATTAACAATGGCAGCTGTCACCAGCCCATATTCAAAATTCCTTCTCTCAATACCCAAATTTACTCTACTTTATAAACTCTCTCTTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020860
ATGCTCATACACTTACTATTCCTCGCTTCATTACTCGGCGCAGCTCATTCTCGAAATGCCACCGTGCAGCCTCTCAAATCACGACCAATTACAGGCGGCGGCGGCGGCGATGCATTCTTCAACCCGCAGCTCCCGCCGCGGGCCCTCTCCGCCTCCGCGAAATTCGAGGGCTCCTCCGACCTCGTCAACCTCCGCTACCACATGGGGCCCGTCCTCTCCTCCCCGATCAACGTCTACCTCATCTGGTACGGCAAGTGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805889.1
MLIHLLFLASLLGAAHSRNATVQPLKSRPITGGGGGDAFFNPQLPPRALSASAKFEGSSDLVNLRYHMGPVLSSPINVYLIWYGKWAPSSQLLIRDFLLSISAAAPRSPSVAEWWRTVALYTDQTGANVSRSLLIAGEYSDRLYSHGRSLTRLSVQEIIATAVRSKPFAVDHKKGIYLVLTATDVAMQDFCRAVCGFHYFTFPSMVGYTLPYAWVGNSATQCPDVCAYPFAVPAYMAGGGPGALRPPNADVGVDGMISVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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