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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004002`

染色体: Chr04 坐标: 55365419-55370492 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004002`
名称	SmilChr04G004002
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase 9
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55365419 - 55370492 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020869`
GeneID	`131020869`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020869`
原始查询	`SmilChr04G004002`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycerol-3-phosphate acyltransferase 9
产物	glycerol-3-phosphate acyltransferase 9
Arabidopsis	`AT5G60620` (GPAT9) glycerol-3-phosphate acyltransferase 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836183] identity=85.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0531600` (P0681F05.133) - identity=77.4; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004366 (glycerol-3-phosphate O-acyltransferase activity); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0019432 (triglyceride biosynthetic process)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01553 (Acyltransferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020869

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805897.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805897.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805897.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805897.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55365905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:55366784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr4:55366822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C37,C45,C48,C6
`Chr4:55366981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B82,C22,C56
`Chr4:55367047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B87,C49
`Chr4:55367361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C36
`Chr4:55367969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr4:55367996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B35
`Chr4:55368421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B89
`Chr4:55368427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:55369064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B51,B61,B67
`Chr4:55369549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805897.1

371 aa

186

371

Acyltransferase

PF01553 Acyltransferase 147-269 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805897.1`	Pfam	`PF01553`	Acyltransferase	Family	147	269	1.1e-25	90.6	Acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949914.1
GCGTAGGCAGGAACGGATTGCGGCTGTGTGAATGAATAGTGTAGTCCCCCACCCCAGAAAAGGAGAGGGAAAAGGGTCAAAAACATTTTATTTTATGTTCAACAATAGCAACACCATTTTAGGGGCGAAATTCACACACACCACACACACTTGACGCATGTTTCTGCAGCAGTGGTGAGAGGATGAGTAAGCTAAACACATCGAGCTCCGAATTGGATTTGGATCGCCCTAACATCGAGGACTATCTTCCATCCGGATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020869
ATGAGTAAGCTAAACACATCGAGCTCCGAATTGGATTTGGATCGCCCTAACATCGAGGACTATCTTCCATCCGGATCCATTCAAGAGCCCCACGGCGAGCTCCGTTTGCGCGATTTGCTCGATATTTCGCCAACTCTGACCGAGGCAGCTGGCGCTATTGTCGATGATTCTTTCACGAGATGCTTCAAGTCAAATCCCCCCGAACCATGGAACTGGAATATATACTTGTTTCCTTTGTGGTGCTTGGGAGTTGTTGTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805897.1
MSKLNTSSSELDLDRPNIEDYLPSGSIQEPHGELRLRDLLDISPTLTEAAGAIVDDSFTRCFKSNPPEPWNWNIYLFPLWCLGVVVRYMILFPTRVIVLTLGWIVFLSCYFPVHFLLKGHEKLRKRLERGLVELICSFFVASWTGVVKYHGPRPSMRPKQVFVANHTSMIDFIVLEQMTAFAVIMQKHPGWVGLLQSTILESLGCIWFNRSESKDREIVARKLREHVHGADNNPLLIFPEGTCVNNHYTVMFKKGAFELG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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