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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004005`

染色体: Chr04 坐标: 55392429-55393504 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004005`
名称	SmilChr04G004005
描述	uncharacterized SmilChr04G004005
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55392429 - 55393504 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020874`
GeneID	`131020874`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020874`
原始查询	`SmilChr04G004005`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G17080; symbol=AT2G17080; hit=AT2G17080; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT2G17080; symbol=AT2G17080; hit=AT2G17080; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G17080` (AT2G17080) - identity=30.8; qcov=0.977; evalue=7.86e-30; confidence=low
Rice	`Os11g0160000` - identity=26; qcov=0.98; evalue=4.54e-12; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020874

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805904.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805904.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805904.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805904.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55392625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55392637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:55392664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B23,B9,C45
`Chr4:55392675`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B121,C14,C32,C45,C68
`Chr4:55392675`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B121,C14,C32,C45,C68
`Chr4:55392678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:55392679`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B121,C14,C32,C45,C68
`Chr4:55392679`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B121,C14,C32,C45,C68
`Chr4:55392683`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B115,B14,B56
`Chr4:55392683`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B115,B14,B56
`Chr4:55392686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B51,C13
`Chr4:55392709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,C11,C69,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805904.1

306 aa

153

306

BPS1

PF03087 BPS1 53-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805904.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	53	303	1.5e-54	186.0	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949921.1
AACAAACAAAAAACACAATGATCTCGAAATCTAAAATCCTTAGCCACACTCGCTCCTCCAGCCTCCCCTCCCGATCCCACCCTCTCATCCCCCAATTCAACGACCATCTCCACCGCCTCCGCGCCGCCACCGCCGCCTCCGACGCCACCTCCCTCCCATCCCTCGCCGAAAACCTAACCAACCTTGACAACCTCCACGGCTGCATCGGCGACCTCCTCCTCCTCCGACACACGCGGCGGGTATTCCGCCGCGAGCGCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020874
ATGATCTCGAAATCTAAAATCCTTAGCCACACTCGCTCCTCCAGCCTCCCCTCCCGATCCCACCCTCTCATCCCCCAATTCAACGACCATCTCCACCGCCTCCGCGCCGCCACCGCCGCCTCCGACGCCACCTCCCTCCCATCCCTCGCCGAAAACCTAACCAACCTTGACAACCTCCACGGCTGCATCGGCGACCTCCTCCTCCTCCGACACACGCGGCGGGTATTCCGCCGCGAGCGCGGCGAGAAATGGGCCGAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805904.1
MISKSKILSHTRSSSLPSRSHPLIPQFNDHLHRLRAATAASDATSLPSLAENLTNLDNLHGCIGDLLLLRHTRRVFRRERGEKWAEQVLDGYLGLVDAWATAKDLLSHAREHVLRLLSLLRRRRRRDLSAFLASRKAARKSAQRTLRNITGLKHKPSAVALDRDAETIAVISMLKEAEAATLDLVESLLCSVAGARRLGGGWSLVSRLISSRNCSGQDRDRGRGRDRDDHKQHILEFCELDAALEKLVSLRRFDGGDGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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