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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004014`

染色体: Chr04 坐标: 55426993-55428468 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004014`
名称	SmilChr04G004014
描述	probable glycosyltransferase At3g07620
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55426993 - 55428468 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020882`
GeneID	`131020882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020882`
原始查询	`SmilChr04G004014`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glycosyltransferase At3g07620
产物	probable glycosyltransferase At3g07620
Arabidopsis	`AT4G38040` (AT4G38040) Exostosin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829960] identity=32.9; qcov=1.02; evalue=1.28e-49; confidence=low
Rice	`Os02g0187200` - identity=34.5; qcov=1.08; evalue=5.28e-56; confidence=low
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03016 (Exostosin_GT47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805911.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805911.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805911.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805911.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55427190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,C76,C9,D10
`Chr4:55427192`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B1,B101,B13,B21,B40,B77,B90,B92,C48,C53,C58,C60,C62,C74,C80,D3
`Chr4:55427300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55427316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr4:55427347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B104,B7,B82,D10
`Chr4:55427353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55427370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C2
`Chr4:55427417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A1,A23,A24,B10,B103,B113,B125,B126,B22,B33,B36,B6,B64,B67,B71,B76,B77,B8,B90,B92,B95,B97,C1,C24,C26,C27,C28,C52,C54,C67,C7,C72,C73,C81
`Chr4:55427427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55427445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B7,B94
`Chr4:55427452`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B7,C20,C26
`Chr4:55427478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,C59,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805911.1

340 aa

170

340

Exostosin_GT47

PF03016 Exostosin_GT47 65-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805911.1`	Pfam	`PF03016`	Exostosin_GT47	Domain	65	289	5.4e-27	95.6	Exostosin GT47 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949928.1
AATTTTAATTATTTAAAAGCAAGATGAAGATGACTAGATGGATACTACTCATTACTATGTGATTTGAAATTATAATCACACTAATGATATTCTAAAAAAAAAAAATCACACTAATGATGATTGAATGATAAAAAAAATTAAATAAAAAAGTGACGAGAATTTCCACGTTTGACAGTTTGATTGAGAGTTGCGAACGCAAATATTCGCTGAGAAAATATCTAAAAATAAAACAAAATCAGCTGAGAGAAAAGTCGGACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020882
ATGGCAGCGGCGGCCGCAATGATCTCTCTCTTCATCGCCGGCCTCTTCATAGCTCGCTCCGCCGCCGCACCATCCCCCTACCTCTCCCCAACCACACTCCCCCAGAGCTACCAAAACATGCTGACAACTCTCAGAATCTTCATCTGCACCCCTTACGCCCCTTTCGATTTTCCCGCCGCCCCGGCCTCTCTCTTCTACAATTCCCTCCTCCGCAGCCCCTTCGTCACCCAAAACCCCGACGAAGCGCACCTCTTCTTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805911.1
MAAAAAMISLFIAGLFIARSAAAPSPYLSPTTLPQSYQNMLTTLRIFICTPYAPFDFPAAPASLFYNSLLRSPFVTQNPDEAHLFFVPFSPDTSTRSMGRVVRELRTDLPYWNRTLGADHFFVSPAGIDYSSDRNILELKKNSIQISVFPVVSGYFIPHKDITLPPPGGSPLELFHRAENSTRTSILGYLRWDGKTELNLVNELKSDSDFLVEEKPAQSESFTESKFCLFLYHGEVAGIVDAMASGCVPVVIVDRPIQDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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