当前解析结果
SmilChr04G004022| 统一新 Gene ID | SmilChr04G004022 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G004022 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G004022 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 55456163 - 55456854 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020890 |
|---|---|
| GeneID | 131020890 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020890 |
| 原始查询 | SmilChr04G004022 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020890 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.60000 | XP_057805919.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057805919.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057805919.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057805919.1 |
| 5 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057805919.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:55456296 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C11 |
Chr4:55456296 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
Chr4:55456307 |
GGC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B135,B60 |
Chr4:55456307 |
GGC |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | B135,B60 |
Chr4:55456334 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,B48,B49,B78,B80 |
Chr4:55456353 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B44,B48,B49,B78,B80 |
Chr4:55456363 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B1,B7,C32,C68 |
Chr4:55456367 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B25,B55 |
Chr4:55456426 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,A9,B128 |
Chr4:55456642 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B1,B140,C48,C82 |
Chr4:55456642 |
GC |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B1,B140,C48,C82 |
Chr4:55456643 |
C |
CTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 37 | A14,B100,B101,B102,B105,B108,B119,B120,B132,B133,B19,B2,B23,B3,B5,B61,B69,B71,B8,B82,C11,C18,C2,C20,C23,C3,C33,C36,C38,C43,C45,C54,C61,C68,C7,C79,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。