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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004040`

染色体: Chr04 坐标: 55638430-55642611 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004040`
名称	SmilChr04G004040
描述	vacuole membrane protein KMS1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55638430 - 55642611 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020910`
GeneID	`131020910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020910`
原始查询	`SmilChr04G004040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuole membrane protein KMS1-like
产物	vacuole membrane protein KMS1-like
Arabidopsis	`AT4G14950` (KMS1) SNARE associated Golgi protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827153] identity=70.7; qcov=0.926; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0778700` - identity=61.6; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27639 (VMP1_C); PF28607 (KMS1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805938.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805938.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057805938.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805938.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55640029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:55640115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:55640421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr4:55640853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:55641093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C74
`Chr4:55641213`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr4:55641213`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr4:55641215`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr4:55641215`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr4:55641546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B17,C74,D4
`Chr4:55641728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B35
`Chr4:55641851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C14,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805938.1

434 aa

217

434

KMS1_N

VMP1_C

PF28607 KMS1_N 4-115 aa PF27639 VMP1_C 381-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805938.1`	Pfam	`PF28607`	KMS1_N	Domain	4	115	2.3e-48	163.4	KMS1 N-terminal domain
`XP_057805938.1`	Pfam	`PF27639`	VMP1_C	Domain	381	414	1.3e-19	70.2	Vacuole membrane protein 1 C-terminal helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949955.1
TGTTTGGTGCCACAATCTAAGCATCAAATATTGAAAAAAATATTATTTTTATCATCATTTATTTTGAAAAAGATACTTCTATTCAAATTACATAGCCTATTTATTTAAAGAAATTTGAAATTACGCCATTTATGATCAAATACTTGGAGTCTTGGACTTTATTTCCCTTTAAAAAAAATCTGCAAATTCAAAATAGTAGTCAAATTCAGTAGATCAGAGTTCTCTTTTCTGCCCATTTTCTGCAACTTGGAGGAATCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020910
ATGGGGTCGAAGAAAAGGTCGACTTCCAACAGTAGTCGTCGCAACGGCGGCGTGTCGCTCTCAGGACTTCGACTGCAGCACCAACAAGAACTAGAAAAATTGACTCTAACCGCCCAGCCATTCAAGACACTAAAGCTATTCCTTTTTGCTGTTATACTATACCTCAGACGATCGCTTACATATGTTTTGTCACATGGCGGTTGGCTTATGCTAGTTAGTGCCCTCGTTGGGGTTGCGGGGATACTACTTGTTATAATAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805938.1
MGSKKRSTSNSSRRNGGVSLSGLRLQHQQELEKLTLTAQPFKTLKLFLFAVILYLRRSLTYVLSHGGWLMLVSALVGVAGILLVIIDGPHDKHVEEVLRYMRFGLWWVALGVASSIGLGSGLHTFVLYLGPHIAFFTLKAVQCGRVDIKSAIYDTIQLKRTPSWLGKDCSEFGPPLFPSSHGVRIPISSILPQVQLEAILWGLGTALGELPPYFISRAASLSGSTVSAMEELDASSTGDKGFISSRLNRMKRWFLSHAQY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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