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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004048`

染色体: Chr04 坐标: 55685043-55688810 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004048`
名称	SmilChr04G004048
描述	uncharacterized SmilChr04G004048
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55685043 - 55688810 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020919`
GeneID	`131020919`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020919`
原始查询	`SmilChr04G004048`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyltransferase C9orf114 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832050]; symbol=AT5G19300; hit=AT5G19300; species=arabidopsis; confidence=high
产物	methyltransferase C9orf114 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832050]; symbol=AT5G19300; hit=AT5G19300; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G19300` (AT5G19300) methyltransferase C9orf114 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832050] identity=70.6; qcov=0.861; evalue=2.51e-155; confidence=high
Rice	`Os04g0244500` - identity=66.8; qcov=0.872; evalue=6.71e-147; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02598 (Methyltrn_RNA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020919

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805953.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057805953.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805953.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805953.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55685607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:55685839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:55685871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:55686070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:55686224`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B44,B48,C79
`Chr4:55686508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B30,B72,C35,C59
`Chr4:55687715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55687717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B79,D11
`Chr4:55687740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr4:55687742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,A7,B80
`Chr4:55688566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:55688584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805953.1

352 aa

176

352

Methyltrn_RNA_3

PF02598 Methyltrn_RNA_3 55-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805953.1`	Pfam	`PF02598`	Methyltrn_RNA_3	Family	55	341	1.7e-106	356.8	Putative RNA methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949970.1
TCGACTCAAAACCCTAATTAAACCTCAAGAATTTACTGCAAGGCCAACTGTGAGAAAGAGAGATGGGGAAGAAGGAGAAGAAGAGAGAGGGAGCTGAAAACATGGAGGCCTTGGGGAACGGCGGTCTCGAATCTAACGAAAAGCGTTCAAAAAAGAAGAGGAAAAACATAGACAAAGTTGAACAACAGCAAAACGACGACGTGCCGTCGACAACTGAGATATCCACCGTCACCATTGCTCTTCCCGGCTCCATAATCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020919
ATGGGGAAGAAGGAGAAGAAGAGAGAGGGAGCTGAAAACATGGAGGCCTTGGGGAACGGCGGTCTCGAATCTAACGAAAAGCGTTCAAAAAAGAAGAGGAAAAACATAGACAAAGTTGAACAACAGCAAAACGACGACGTGCCGTCGACAACTGAGATATCCACCGTCACCATTGCTCTTCCCGGCTCCATAATCAATAATACTCAATCCCTCGAACTCGCTACTCGTTTGGCTGGGCAGGTTGCGCGTGCTGCAGCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805953.1
MGKKEKKREGAENMEALGNGGLESNEKRSKKKRKNIDKVEQQQNDDVPSTTEISTVTIALPGSIINNTQSLELATRLAGQVARAAAIFRIDEVVVFDSKNTSEDASTEIMDNDSGENESGAAFLMRILRYLETPQYLRKSLFPMHSSLRVVGLLPPLDAPHHLRKHEWAQYREGIAREKLDQGTLVDVGLSKNIKVDQVLEPGTRVTVEMGTNRNLDAGPRKIVPSSRPRDEGMYWGYKVRYAPNISSVFKNCPYQGGYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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