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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004057`

染色体: Chr04 坐标: 55716952-55718902 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004057`
名称	SmilChr04G004057
描述	uncharacterized SmilChr04G004057
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55716952 - 55718902 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020926`
GeneID	`131020926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020926`
原始查询	`SmilChr04G004057`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	IGR motif protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819750]; symbol=AT3G05810; hit=AT3G05810; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	IGR motif protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819750]; symbol=AT3G05810; hit=AT3G05810; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G05810` (AT3G05810) IGR motif protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819750] identity=57.9; qcov=1.01; evalue=9.33e-41; confidence=medium
Rice	`Os01g0299400` - identity=57.8; qcov=0.796; evalue=6.34e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09597 (SAM_Ribosomal_mS41)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805960.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057805960.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805960.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805960.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805960.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55718426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:55718448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B9,B93,C46,D11
`Chr4:55718719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805960.1

113 aa

113

SAM_Ribosomal_mS41

PF09597 SAM_Ribosomal_mS41 42-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805960.1`	Pfam	`PF09597`	SAM_Ribosomal_mS41	Domain	42	102	1e-17	64.7	Small ribosomal subunit protein mS41 SAM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949977.1
GAAAAAGAATATTTGAGACGCTGTCGTTTAGAAAGGCCAGAACATTCTTTAGGGTTTATGCTCGCTCTCTAGAGAGAAAATCCGAAATCTATTTTCCCCTATTTTTGATATGGCTTTTTGGAGGCAAATCCTGACGGGAAGCAGCCGGTTATCCTCATTTGCCACGAATTCGAGTCATGTATCCGGAATTTCAAATTTCTCCACCAAATCCAGCCATTACATTGTGAAAGTTGGGATTCCGGAGTTCCTGAATGGAGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020926
ATGGCTTTTTGGAGGCAAATCCTGACGGGAAGCAGCCGGTTATCCTCATTTGCCACGAATTCGAGTCATGTATCCGGAATTTCAAATTTCTCCACCAAATCCAGCCATTACATTGTGAAAGTTGGGATTCCGGAGTTCCTGAATGGAGTGGGGCGAGGATTGGGAAATCACGTAGAGAAGTTGGAATCTGAGATCGGAGACTTGAATAAGCTACTCGTCACTCGAACCATTAAGCTCAAGCGGCTCGGGATTCCTTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805960.1
MAFWRQILTGSSRLSSFATNSSHVSGISNFSTKSSHYIVKVGIPEFLNGVGRGLGNHVEKLESEIGDLNKLLVTRTIKLKRLGIPCKDRKLILKYAHKYRLGLWRPRAEPVKS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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