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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004074`

染色体: Chr04 坐标: 55827441-55829093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004074`
名称	SmilChr04G004074
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55827441 - 55829093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020948`
GeneID	`131020948`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020948`
原始查询	`SmilChr04G004074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histidine-containing phosphotransfer protein 1-like
产物	histidine-containing phosphotransfer protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G21510` (AHP1) histidine-containing phosphotransmitter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821705] identity=69.3; qcov=0.974; evalue=6.44e-68; confidence=high
Rice	`Os08g0557700` (AHP1) - identity=50; qcov=0.922; evalue=1.95e-46; confidence=medium
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009927 (histidine phosphotransfer kinase activity); GO:0016310 (phosphorylation); GO:0043424 (protein histidine kinase binding)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01627 (Hpt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020948

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805982.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805982.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805982.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805981.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057805982.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55827809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:55828615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:55828792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C48
`Chr4:55828805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B80,C13,D6
`Chr4:55828822`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr4:55828822`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr4:55828831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B129,C41
`Chr4:55828847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	D10,D11,D3
`Chr4:55828847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	D10,D11,D3
`Chr4:55828853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C40
`Chr4:55828862`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A9,B10,B123,B135,B14,B23,B25,B26,B37,B55,B63,B66,B79,B84,B94,B99,C10,C29,C36,C52,C61,C70,C86,D4
`Chr4:55828874`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	109	A13,A14,A18,A19,A22,A23,A24,A9,B100,B101,B105,B106,B107,B110,B111,B113,B114,B115,B119,B121,B122,B125,B127,B13,B130,B133,B136,B139,B15,B16,B18,B24,B26,B27,B31,B32,B34,B38,B39,B42,B43,B45,B46,B47,B49,B50,B54,B57,B58,B61,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B76,B77,B85,B86,B88,B94,B97,B99,C11,C16,C17,C20,C21,C22,C23,C25,C28,C3,C31,C34,C35,C37,C38,C39,C43,C44,C46,C47,C51,C54,C58,C59,C6,C60,C63,C69,C7,C71,C72,C75,C78,C80,C84,C85,C9,D10,D11,D3,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805981.1

187 aa

187

Hpt

PF01627 Hpt 44-123 aa

XP_057805982.1

154 aa

154

Hpt

PF01627 Hpt 44-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805981.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	44	123	7.1e-15	55.7	Hpt domain
`XP_057805982.1`	Pfam	`PF01627`	Hpt	Domain	44	123	4.2e-15	56.5	Hpt domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949999.1
CTGTGCGTTTTATCTTCTTGTTCCCTTTTTTTTCCCTTCAATCTTGATAATTATATATGAAAAAAAAAGTGTTACTTTTTGTCAATATAGTATATTAGTGGTGGAAATTAAAAGGATGGATGAAAGTGAGATTAGGAAGAAAAACTTATGTATATATATAAAAAAGATGGAATAAAATTATGCATATTGAACAAGCCAAAAGAGGTGGTGGCCTGTAATTTGTAAATATAGAATTTAGATAATTTAAATGCTCCTCGAAT...

XM_057949998.1
CTTGTTCCCTTTTTTTTCCCTTCAATCTTGATAATTATATATGAAAAAAAAAGTGTTACTTTTTGTCAATATAGTATATTAGTGGTGGAAATTAAAAGGATGGATGAAAGTGAGATTAGGAAGAAAAACTTATGTATATATATAAAAAAGATGGAATAAAATTATGCATATTGAACAAGCCAAAAGAGGTGGTGGCCTGTAATTTGTAAATATAGAATTTAGATAATTTAAATGCTCCTCGAATAATCTAAAAGGGAAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020948
ATGGAGGTGGAGCAGCTGCAGAGTAGCTTCATTGAGTATACAAGTGGTCTGTTTCGTGAGGGATTCTTGGATGGTCAGTTTAGTCAGCTGCAGCTGCTTCAAGATGAAACCAATCCAGATTTTGTGTTTGAAGTTGTTTCCCTTTTCTTTGAGGATTCTGAGAGGCTCCTCCATGATCTCTCTCTAGCTTTAGATCAGCAGAATGTGGACTTCAAGAAGATTGATGCTCATGTTCACCAGTTCAAAGGCAGCAGCTCTAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805981.1
MEVEQLQSSFIEYTSGLFREGFLDGQFSQLQLLQDETNPDFVFEVVSLFFEDSERLLHDLSLALDQQNVDFKKIDAHVHQFKGSSSSIGAHRVKNTCIAFRGFCEEQNVEGCLRCLQQVKQEYLLVKTKLEALLRVSFPPASVVRSIRTNDVFPEMRPEIVILSAVFFFVAVGAADCGSWWNNSHVE

XP_057805982.1
MEVEQLQSSFIEYTSGLFREGFLDGQFSQLQLLQDETNPDFVFEVVSLFFEDSERLLHDLSLALDQQNVDFKKIDAHVHQFKGSSSSIGAHRVKNTCIAFRGFCEEQNVEGCLRCLQQVKQEYLLVKTKLEALLRLEQQIVAAGGTIPMLNEFC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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