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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004075`

染色体: Chr04 坐标: 55829196-55833935 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004075`
名称	SmilChr04G004075
描述	squamosa promoter-binding-like protein 7
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55829196 - 55833935 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020947`
GeneID	`131020947`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020947`
原始查询	`SmilChr04G004075`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmSPL7` P037; 2021	`KF437883`	`LOC131020947` `SmilChr04G004075` GeneID 131020947	nucleotide; identity 98.546%; coverage 100.0%	High-confidence sequence match	NCBI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	squamosa promoter-binding-like protein 7
产物	squamosa promoter-binding-like protein 7
Arabidopsis	`AT5G18830` (SPL7) squamosa promoter binding protein-like 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832001] identity=43.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os05g0408200` (OsSPL9) - identity=38.5; qcov=1.07; evalue=2e-165; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03110 (SBP); PF26102 (Ig_SPL7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020947

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805979.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057805979.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805979.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057805979.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805979.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55829594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B104
`Chr4:55829628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:55829654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:55829655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B8
`Chr4:55829688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B19,C28,D9
`Chr4:55829700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,B91
`Chr4:55829808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:55829813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr4:55829837`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A20,A3,A7,A8,B1,B100,B101,B103,B12,B128,B138,B24,B41,B54,B56,B64,B67,B7,B76,B81,B86,B87,B93,B96,C18,C21,C24,C27,C4,C46,C49,C61,C64,C66,C72,C73,C78,D1
`Chr4:55829839`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	38	A20,A3,A7,A8,B1,B100,B101,B103,B12,B128,B138,B24,B41,B54,B56,B64,B67,B7,B76,B81,B86,B87,B93,B96,C18,C21,C24,C27,C4,C46,C49,C61,C64,C66,C72,C73,C78,D1
`Chr4:55829945`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	119	A10,A19,A2,A20,A23,A25,A3,A4,A7,A8,B1,B100,B101,B103,B107,B11,B114,B115,B117,B119,B12,B121,B128,B130,B132,B133,B136,B138,B16,B18,B21,B24,B25,B26,B30,B31,B32,B33,B34,B41,B44,B45,B46,B49,B5,B50,B54,B56,B59,B6,B61,B64,B67,B69,B7,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B84,B85,B86,B87,B9,B93,B96,C10,C11,C13,C14,C18,C19,C20,C21,C24,C25,C27,C31,C32,C35,C37,C39,C4,C40,C46,C48,C49,C50,C53,C58,C59,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C72,C73,C76,C78,C82,C83,C84,C85,C86,D1,D10,D11,D4,D6,D8
`Chr4:55829949`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	181	A1,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B10,B102,B103,B105,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B127,B128,B130,B131,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B53,B55,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B73,B74,B75,B78,B79,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C29,C3,C30,C32,C33,C36,C37,C38,C39,C40,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C80,C81,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805979.1

778 aa

389

778

SBP

Ig_SPL7

PF03110 SBP 126-200 aa PF26102 Ig_SPL7 411-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805979.1`	Pfam	`PF03110`	SBP	Domain	126	200	1.4e-28	99.7	SBP domain
`XP_057805979.1`	Pfam	`PF26102`	Ig_SPL7	Domain	411	522	1.9e-34	118.9	SPL7-like, immunoglobulin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949996.1
GCTTCCTCTTCGTGTCGCCACCTAACGACACCCATTTTCTCAAGAGTCAAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGTGGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGTGGAAAGAGGGAGACTTTTCTAACTCCTAATCGGTAAAATCCTCTGTCCCCTTCTCCCAATTCTCCCATTTTCTCGGCAACCTCAAAAATCCCAAATCCCTCCAATAATGCAGCAAAATCCATCATCGCACCCAACCCCAATTCCACCAACCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020947
ATGCAGCAAAATCCATCATCGCACCCAACCCCAATTCCACCAACCGAAGCCCTAATTCCGGCCGACGACCCCGCCGCGTCGTCCCTCTTCGACTGGTCGGATTTCCTCGACTTCAACCTCGATGAGGGCGGCCTCCACGCCGCGCCGTCGCTTCCCCAATCCGAGCAGGAGCAGGAGCAGCCCGGGGGGTTTGACCCGGGCCAGGAGAAGCCCGGCGCGGTGAGGAAGAGGGACCCGAGATTGCTGTGCTCCAATTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805979.1
MQQNPSSHPTPIPPTEALIPADDPAASSLFDWSDFLDFNLDEGGLHAAPSLPQSEQEQEQPGGFDPGQEKPGAVRKRDPRLLCSNFLARVPCACPELDQKLAEEERELPGKKRTRIARGPGGPARCQVPGCEADISELKGYHRRHRVCLRCANAGSVLLDGDSKRYCQQCGKFHILSDFDEGKRSCRRKLERHNNRRRRKPNDSKEGAEKESQLIVLADDLSGDDDAGKDGISVNGQIEDKELLLESDGQVSALGSQTLQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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