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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004078`

染色体: Chr04 坐标: 55846517-55848858 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004078`
名称	SmilChr04G004078
描述	U1 small nuclear ribonucleoprotein C-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55846517 - 55848858 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020951`
GeneID	`131020951`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020951`
原始查询	`SmilChr04G004078`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U1 small nuclear ribonucleoprotein C-like
产物	U1 small nuclear ribonucleoprotein C-like
Arabidopsis	`AT4G03120` (AT4G03120) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828071] identity=69.6; qcov=0.56; evalue=1.17e-46; confidence=medium
Rice	`Os02g0266100` - identity=65.1; qcov=0.76; evalue=4.41e-57; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0000395 (mRNA 5'-splice site recognition); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005634 (nucleus); GO:0005685 (U1 snRNP); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030627 (pre-mRNA 5'-splice site binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06220 (zf-U1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020951

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805985.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057805985.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805985.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805985.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805985.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55846818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B49,C16,C30,D5
`Chr4:55847548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C71
`Chr4:55847566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr4:55847588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55847621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B28,B44,D11
`Chr4:55847684`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr4:55847684`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr4:55847687`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B103
`Chr4:55847971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B28,B44,C60,D11
`Chr4:55847985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:55848046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805985.1

200 aa

100

200

zf-U1

PF06220 zf-U1 1-38 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805985.1`	Pfam	`PF06220`	zf-U1	Domain	1	38	1.2e-21	76.9	U1 zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950002.1
CGTCAGTTTGTCGAAGCTATTTTTCGTACAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCGCTCGAGCGATAAACCCTATAATTTCCCCCCCAAAACCCACTCGAATCACAATTGGATTTAATTTTGTTCACCGATTTGAATTTTTTCTCGGATTTATCAGAAATTCTCTCACTAATGCCGCGGTACTACTGTGATTATTGCGACACGTACTTGACTCATGATTCTCCTTCTGTCAGAAAGCAGCATAATGCTGGCTACAAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020951
ATGCCGCGGTACTACTGTGATTATTGCGACACGTACTTGACTCATGATTCTCCTTCTGTCAGAAAGCAGCATAATGCTGGCTACAAACATAAGGCAAACATAAGATCCTACTACCAAAAGTTTGAGGAACAACAAACTCAGATTTTGATCGATCAGAAGATCAAGGAGCATCTTGGGCAGACAGTAGTATACCAACAGATTGGTGCAGCTTATAACCAACATCTTGCTGCTTTTCCTGGAGCAAGGCCGCGCCTACCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805985.1
MPRYYCDYCDTYLTHDSPSVRKQHNAGYKHKANIRSYYQKFEEQQTQILIDQKIKEHLGQTVVYQQIGAAYNQHLAAFPGARPRLPVMPPPMFPGPPQMVPGMRPPILPIPVPGAPGYGNSPMAPMQPPPAPSLPPQTGGLPPPPSTSTPSPVPGGGQPPSSSSVPPNATQMYNVNPPGTSAASATAGGYSYPQYSQTGH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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