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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004080`

染色体: Chr04 坐标: 55855346-55857541 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004080`
名称	SmilChr04G004080
描述	uncharacterized SmilChr04G004080
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55855346 - 55857541 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020952`
GeneID	`131020952`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020952`
原始查询	`SmilChr04G004080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsDjC76; symbol=OsDjC76; hit=Os11g0578100; species=rice; confidence=low
产物	OsDjC76; symbol=OsDjC76; hit=Os11g0578100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G18740` (AT5G18740) - identity=39.9; qcov=0.38; evalue=3.93e-39; confidence=low
Rice	`Os11g0578100` (OsDjC76) - identity=42.1; qcov=0.361; evalue=3.04e-43; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF11926 (DUF3444)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020952

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805986.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805986.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805986.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805986.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55855653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D8
`Chr4:55855662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr4:55855685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr4:55855774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C71
`Chr4:55855824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:55855887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B5
`Chr4:55855927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B41,B68,C36
`Chr4:55855935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B91
`Chr4:55855960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C4,C49
`Chr4:55855961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr4:55855968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,D6
`Chr4:55856001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B129,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805986.1

613 aa

306

613

DnaJ

DUF3444

PF00226 DnaJ 61-122 aa PF11926 DUF3444 395-592 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805986.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	61	122	1.6e-16	60.9	DnaJ domain
`XP_057805986.1`	Pfam	`PF11926`	DUF3444	Family	395	592	1.1e-62	212.1	Domain of unknown function (DUF3444)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950003.1
TTTCCAACCTTCAAATTTCCTCTTCACAAAAACCCCTCCAAAATTCCCCCTTTTTCCATAACTCCGCCGCAGAAAAAAAGAAAAAGATGGAGACAGCGGCGGCGAAGGAAGCGGCCCTCGAGAAGATGAGAAACGGCGACTTCTCCGGCGCCCTCGAGCTCGCAGTCGAAGCGCGCAACCTCTCCCCCGGCGTTGGGGGTTTCGATCAGATGATCACCGTCTGCAACGTGCATTGCGCCGCCGCCGCGGGCGGCGGCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020952
ATGGAGACAGCGGCGGCGAAGGAAGCGGCCCTCGAGAAGATGAGAAACGGCGACTTCTCCGGCGCCCTCGAGCTCGCAGTCGAAGCGCGCAACCTCTCCCCCGGCGTTGGGGGTTTCGATCAGATGATCACCGTCTGCAACGTGCATTGCGCCGCCGCCGCGGGCGGCGGCGACGGCAAGGACTGGTACAAGATTCTCGGCGTCGCGGAGGAGGCCGACGAGGCGGCCGTCCGGCGGCAGTGCGGCAAGATGTGGATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805986.1
METAAAKEAALEKMRNGDFSGALELAVEARNLSPGVGGFDQMITVCNVHCAAAAGGGDGKDWYKILGVAEEADEAAVRRQCGKMWMALHPDKNGLPGASEAFQLIVEAKAVLGDSEKRRVYDSSRRADAMEGQWGFGFSRFRECAESNGFGRFRGKTNEPSTAKLDGEDENLDFGFSRFLNDQKIDWSSNGVIDSGGFNWDNAALMLQNDRRGRGRGRGRGRGSKLNEPNNIKEKATIGRGRGSKLNEPNNIKEKATAKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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