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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004094`

染色体: Chr04 坐标: 55930171-55933893 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004094`
名称	SmilChr04G004094
描述	serine/threonine-protein kinase PBL27-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55930171 - 55933893 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020969`
GeneID	`131020969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020969`
原始查询	`SmilChr04G004094`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase PBL27-like
产物	serine/threonine-protein kinase PBL27-like
Arabidopsis	`AT5G18610` (AT5G18610) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831979] identity=75.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0936100` (OsRLCK55) - identity=68.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806010.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806010.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806010.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806010.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806010.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55930706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B3,C15,C64,C66
`Chr4:55930707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D10
`Chr4:55930754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:55930780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:55930795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:55930858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B30,C63,C81
`Chr4:55930882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:55930922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:55930981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C47,D11
`Chr4:55931011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:55931260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55931284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C63,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806010.1

509 aa

254

509

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 94-292 aa PF00069 Pkinase 94-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806010.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	94	292	6e-45	154.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057806010.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	94	304	1.1e-44	153.6	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950027.1
GAGCAGCAGAAAAACAAATTCTTGCACATTAATTTATTTGATTTTCCTTTTGCTTCTTCTTCGAATTCAGCTTTATTTTATTTTTAATATTTTATTTTAATTTTGCTCCTCTTCCTTCACCATACTTTTCAAGAATCAACGATTTTCTTCGATTTGTTGATCTACTTTATTTTTTTAAGCAGTGTGCTGATCCCGAATATTGAGCTAATTGGAATAATTGATCATTTCCTCACGGCTACAAAAAACCCCTCCAAAAAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020969
ATGGGTGGGTGTGTTCCTTGCTTTGGATCATCAAATAAGGAAGGAAATGGCAATAATTGTGATAATGGAGTGAAAGAAATGGGGAAAAAGGAGTCTTTCAAAGACGGTTCAGCTCCTCATTCTAATAATAGAGTGAGTTCAGAAAAATCAAAAGCTCGAAATAGTAGTGATTCCAAGAAGGAACCAGGGATTCCAAAAGAGCCAACAGCTCATATTGCTGCCCAGACCTTCACGTTTAGGGACCTTGCTGCAGCGACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806010.1
MGGCVPCFGSSNKEGNGNNCDNGVKEMGKKESFKDGSAPHSNNRVSSEKSKARNSSDSKKEPGIPKEPTAHIAAQTFTFRDLAAATKNFRPECLLGEGGFGRVYKGKLESGQVVAVKQLDRNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLIGYCADGDQRLLVYEYMPLGSLEDHLHDLPPDKQPLDWNTRMKIAAGAAKGLEYLHDKANPPVIYRDLKSSNILLDEGYFPKLSDFGLAKLGPVGDKTHVSTRVMGTYGYCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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