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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004107`

染色体: Chr04 坐标: 56020002-56021164 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004107`
名称	SmilChr04G004107
描述	protein SRC2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56020002 - 56021164 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020983`
GeneID	`131020983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020983`
原始查询	`SmilChr04G004107`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SRC2-like
产物	protein SRC2-like
Arabidopsis	`AT3G16510` (AT3G16510) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820899] identity=37.3; qcov=0.765; evalue=2.32e-35; confidence=medium
Rice	`Os01g0934100` - identity=42.5; qcov=0.544; evalue=5.26e-28; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057806034.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806034.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806034.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806034.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806034.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56020236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B101,B24,B35
`Chr4:56020254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D4
`Chr4:56020302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr4:56020413`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:56020460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B61
`Chr4:56020462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,B8,B83
`Chr4:56020489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:56020567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr4:56020628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr4:56020733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:56020880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr4:56020953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806034.1

294 aa

147

294

PF00168 C2 5-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806034.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	5	103	5.2e-13	49.8	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950051.1
ATTACATTTACATATGATGTGCTCATTGCTCACAATATATCTCAGAATTTCTTGTGGAATTCTGGGAAGCTTCCCTCTCTCTCTACAAATAGTGGTATTTTATTTGAGATTTAAAAATAGAAAATAAAAAATGGGTTGCGCAACTCTAGAAATCACGGTTCAATACGCCGAGGATTTGAACAAGGTAAATTTCATCTCGAAAATGGACGTCTACGTCGTCGTTTCGATCTCCGGCGGGGACGAAGCCTCCAAGCAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020983
ATGGGTTGCGCAACTCTAGAAATCACGGTTCAATACGCCGAGGATTTGAACAAGGTAAATTTCATCTCGAAAATGGACGTCTACGTCGTCGTTTCGATCTCCGGCGGGGACGAAGCCTCCAAGCAGAAGACTAAAACAGTGGTGGATCACGGCGGCGACGCCAACCCCACGTGGAGTTTTCCTATGAAGTTCGCGGTGGAGGAGGCGGCGCTGCTGCAAAACCGCCTCGTGCTGGACTTCTATATCAAGTGCGAGAGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806034.1
MGCATLEITVQYAEDLNKVNFISKMDVYVVVSISGGDEASKQKTKTVVDHGGDANPTWSFPMKFAVEEAALLQNRLVLDFYIKCERALVNRLIGEVHVPVKELLDFPAKGHGGAATKNFVSYQVKKPDGRPKGKLTFSYQFHGKTAASSMPPPPPPAAAAALHGSSTIAYPVVEPISPYLVMAAGGYSPFQPESAAAEYTPSYVPAALGVYPPNVPPQPAAVSPEVCEGQYPPPPSYLPDCSMIKPEWYPPPPLPPPCFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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