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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004110`

染色体: Chr04 坐标: 56035026-56036923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004110`
名称	SmilChr04G004110
描述	xyloglucan 6-xylosyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56035026 - 56036923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020986`
GeneID	`131020986`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020986`
原始查询	`SmilChr04G004110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	xyloglucan 6-xylosyltransferase 2-like
产物	xyloglucan 6-xylosyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT3G62720` (XT1) xylosyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825446] identity=76; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0300000` (OsXXT1) - identity=72.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016758 (hexosyltransferase activity); GO:0033843 (xyloglucan 6-xylosyltransferase activity); GO:0035252 (UDP-xylosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05637 (Glyco_transf_34)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057806037.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057806037.1`
3	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057806037.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806037.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56035466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B28,C6,C70
`Chr4:56035480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	178	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A25,A5,A7,A8,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B106,B108,B110,B113,B114,B115,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B135,B137,B139,B14,B15,B19,B20,B21,B23,B25,B26,B27,B28,B3,B31,B32,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B65,B66,B68,B7,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C18,C19,C21,C22,C24,C25,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C70,C71,C73,C74,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D5,D8,D9
`Chr4:56035504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C8
`Chr4:56035513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr4:56035553`	`TG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A25,B15,B7
`Chr4:56035673`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr4:56035673`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr4:56035702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:56035716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B76,C8,D8
`Chr4:56035759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B91,B98,C11,C69
`Chr4:56035760`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B1,B101,B22,B28,C20,C6,C70
`Chr4:56035824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806037.1

461 aa

230

461

Glyco_transf_34

PF05637 Glyco_transf_34 154-393 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806037.1`	Pfam	`PF05637`	Glyco_transf_34	Family	154	393	2.6e-67	227.7	galactosyl transferase GMA12/MNN10 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950054.1
AAACCAAAAGAAAAACAGAGATTTATTTTTTGAAAAAGACACAAGACTTTCTTACAAACCAAAAAGGGCATACGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAATTAAAAGAAATTATTGTCTGAATTCCGAATCCCAGCTTTCATTCTCCATTTCTCATCTCCAATTCAACTCTCCCACTCTCGACCGACACAAAATCATCTCCGCCGTTTCGTAAAACCCATCTCAAATTCCATCCAAGATCCCATTTTTTATCAATATTTGTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020986
ATGATAGGTCGGCTGCTCGGCCCGCGCCGGGCCCGCCAGCTGCAGCGGTTCGTGCGCAACGGTAAGCTCACAATCCTCTGCCTTTTCCTCACCGTGATAATGTTTCGCGGGTATTTGGGCGCCGGAAGATTCGGCACGCCGGAGAAGGATCTCGACGACATCCGCGAAACCCTCTCCTACATCCGCAGACGGGCCGAGCCGCGGCGGGTTCTCGAGGAGGCTTTAATGGCGGCTCAAGGGGAGCTGAAATCAGCCGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806037.1
MIGRLLGPRRARQLQRFVRNGKLTILCLFLTVIMFRGYLGAGRFGTPEKDLDDIRETLSYIRRRAEPRRVLEEALMAAQGELKSAENAAAGSNNYTDFDISKIFRDEDDGVEEFRRDPSQPYSLGPKISNWDEQRAEWLERNPKFPNFSGRINKPRVLLVTGSSPKPCENPVGDHYLLKSIKNKIDYCRLHGIEIFYNMALLDAEMSGFWAKLPLIRKLLLSHPEVEFLWWMDSDAMFTDMAFELPWERYKDVNLVMHGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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