当前解析结果
SmilChr04G004112| 统一新 Gene ID | SmilChr04G004112 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G004112 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G004112 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 56039108 - 56039458 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023652 |
|---|---|
| GeneID | 131023652 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023652 |
| 原始查询 | SmilChr04G004112 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os07g0673801; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os07g0673801; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os07g0673801- identity=43.6; qcov=0.474; evalue=6.51e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023652 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057809178.1 |
| 2 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057809178.1 |
| 3 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057809178.1 |
| 4 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057809178.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809178.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:56039155 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr4:56039174 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C71,D7 |
Chr4:56039195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B55 |
Chr4:56039312 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B5,C71,D7 |
Chr4:56039429 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B124,B50,C35,C61,C84 |
Chr4:56039452 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。