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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004136`

染色体: Chr04 坐标: 56161622-56166159 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004136`
名称	SmilChr04G004136
描述	myb-related protein 330-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56161622 - 56166159 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021014`
GeneID	`131021014`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021014`
原始查询	`SmilChr04G004136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	myb-related protein 330-like
产物	myb-related protein 330-like
Arabidopsis	`AT2G47460` (MYB12) myb domain protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819359] identity=62; qcov=0.533; evalue=6.85e-67; confidence=medium
Rice	`Os03g0303500` - identity=58.5; qcov=0.637; evalue=9.52e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021014

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806072.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806072.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806072.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806072.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56161788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	166	A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B104,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B128,B13,B131,B132,B134,B136,B139,B15,B17,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B44,B46,B47,B5,B53,B54,B55,B6,B61,B62,B63,B65,B66,B68,B7,B70,B74,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B92,B94,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C17,C18,C2,C20,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C78,C8,C80,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D9
`Chr4:56161789`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A2,A21,B11,B114,B122,B131,B133,B35,B42,B48,B49,B52,B57,B59,B6,B61,B64,B69,B7,B73,B75,B76,B8,B86,B91,B93,B99,C23,C40,C41,C50,C63,C75
`Chr4:56161797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:56161822`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B100,B124,B51,B83,C42
`Chr4:56161822`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B100,B124,B51,B83,C42
`Chr4:56161866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B78,C49,C72
`Chr4:56162063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:56162130`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A2,B75,C63
`Chr4:56162130`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A2,B75,C63
`Chr4:56162204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:56162284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:56162294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B51,B83,C42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806072.1

306 aa

153

306

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 14-61 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 17-76 aa PF00249 Myb_DNA-binding 67-112 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806072.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	14	61	2.3e-34	117.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057806072.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	17	76	7.8e-22	78.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057806072.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	67	112	2.3e-34	117.9	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057806072.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	119	7.8e-22	78.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950089.1
TCAAGTAAGAAATCACTATAAATTCAAACTCGTAGTGGCAAGAAGCAACAACTCTCTTTATGTGGAGGTCGAGGACGAGGACGTGGACGTGGACGAGAACGAGCCAGTCAAATCTCTCCTCATTTCGAGAGAGAAAATGGGGAGAAGTCCTTGTTGTGAAAAAACCGGTTTGAATAGAGGCAAATGGACCGCTGAAGAAGATGGTAAATTGGTTAGCTACATCAAGGCCAATGGCGAGGGCTCTTGGAGATCACTACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021014
ATGGGGAGAAGTCCTTGTTGTGAAAAAACCGGTTTGAATAGAGGCAAATGGACCGCTGAAGAAGATGGTAAATTGGTTAGCTACATCAAGGCCAATGGCGAGGGCTCTTGGAGATCACTACCAAAGAATGCGGGTTTGTTGAGATGCGGGAAGAGCTGCAGACTGAGGTGGATTAACTACTTGAGAGCTGATGTGAAGAGAGGGAACTTTACTGAACAAGAAGAGGAGACCATTGTGAAGCTGCACAAGACTTTGGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806072.1
MGRSPCCEKTGLNRGKWTAEEDGKLVSYIKANGEGSWRSLPKNAGLLRCGKSCRLRWINYLRADVKRGNFTEQEEETIVKLHKTLGNRWSLIASHLPGRTDNEIKNYWNSHLSRTIYRYRFIGEATLTQADMIKIAPKSRCRDHRRGKNAAPPAQHHVASAQVPAEERNDEGKSDSFSSCDTLSTKGSPDALMLSPNDAQEVEEMLGPSTEIDADILMHLNNFPGNEKTNQCRGDGDGFMAYTAASEERDCCGDGGWNSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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