当前解析结果
SmilChr04G004141| 统一新 Gene ID | SmilChr04G004141 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G004141 |
| 描述 | outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 56182012 - 56184519 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021019 |
|---|---|
| GeneID | 131021019 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021019 |
| 原始查询 | SmilChr04G004141 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | outer envelope pore protein 16-2, chloroplastic-like |
| 产物 | outer envelope pore protein 16-2%2C chloroplastic-like |
| Arabidopsis | AT4G16160 (ATOEP16-2)Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827308] identity=57.1; qcov=0.91; evalue=3.03e-30; confidence=medium |
| Rice | Os03g0305600- identity=54.1; qcov=0.98; evalue=1.57e-28; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021019 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057806078.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057806078.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057806078.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806078.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806078.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:56183455 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B94,C42 |
Chr4:56183687 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,C56 |
Chr4:56183843 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,C56 |
Chr4:56183850 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C70 |
Chr4:56184010 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。