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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004144`

染色体: Chr04 坐标: 56198183-56201929 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004144`
名称	SmilChr04G004144
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 9A
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56198183 - 56201929 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021026`
GeneID	`131021026`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021026`
原始查询	`SmilChr04G004144`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases II, IV and V subunit 9A
产物	DNA-directed RNA polymerases II%2C IV and V subunit 9A
Arabidopsis	`AT3G16980` (NRPB9A) RNA polymerases M/15 Kd subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820954] identity=88.6; qcov=1; evalue=1.61e-76; confidence=high
Rice	`Os03g0102200` (SDRP) - identity=79.8; qcov=1; evalue=2.53e-70; confidence=high
GO	GO:0001193 (maintenance of transcriptional fidelity during transcription elongation by RNA polymerase II); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0006283 (transcription-coupled nucleotide-excision repair); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01096 (Zn_ribbon_TFIIS); PF02150 (Zn_ribbon_RPB9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021026

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806087.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057806087.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806087.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806087.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057806087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806087.1

114 aa

114

Zn_ribbon_RPB9

Zn_ribbon_TFIIS

PF02150 Zn_ribbon_RPB9 4-36 aa PF01096 Zn_ribbon_TFIIS 75-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806087.1`	Pfam	`PF02150`	Zn_ribbon_RPB9	Domain	4	36	5.1e-12	46.2	RNA polymerases M/15 Kd subunit
`XP_057806087.1`	Pfam	`PF01096`	Zn_ribbon_TFIIS	Domain	75	113	3.7e-12	46.6	Transcription factor S-II (TFIIS)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950104.1
CTTTTTCGTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTGTAAAACTTGCTGAAACTACTCCCAGCTTCCAGCTTCGAACTCAAGCACAGACGCAAACGAGAAAATTTCAAAAATTTCCCAACTTTCACCATGAGTACCATGAAATTTTGCCGCGAATGCAACAATATACTGTACCCGAAGGAAGACAAAGAGCAGAAGATTCTGCTTTACGCTTGCCGCAATTGTGATCACCAGGAAGTTGCTGACAACAACTGCGTTTATAGAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021026
ATGAGTACCATGAAATTTTGCCGCGAATGCAACAATATACTGTACCCGAAGGAAGACAAAGAGCAGAAGATTCTGCTTTACGCTTGCCGCAATTGTGATCACCAGGAAGTTGCTGACAACAACTGCGTTTATAGAAATGAGATACACCATTCTGTTGGAGAGCGCACCCAAGTTCTGCAAGACGTGGCTGCAGATCCAACACTCCCACGAACAAAATCAGTTCGTTGTGCAAATTGTGGTCACGGAGAAGCTGTTTTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806087.1
MSTMKFCRECNNILYPKEDKEQKILLYACRNCDHQEVADNNCVYRNEIHHSVGERTQVLQDVAADPTLPRTKSVRCANCGHGEAVFFQATARGEEGMTLFFVCCNPNCGNRWRD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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