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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004147`

染色体: Chr04 坐标: 56203971-56205670 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004147`
名称	SmilChr04G004147
描述	DELLA protein RGL1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56203971 - 56205670 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021027`
GeneID	`131021027`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021027`
原始查询	`SmilChr04G004147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DELLA protein RGL1-like
产物	DELLA protein RGL1-like
Arabidopsis	`AT1G66350` (RGL1) RGA-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842953] identity=27.8; qcov=0.818; evalue=2.94e-38; confidence=low
Rice	`Os03g0723000` (OsSCRL) - identity=30; qcov=0.766; evalue=8.4e-35; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021027

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806088.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806088.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806088.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806088.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806088.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56204160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C44
`Chr4:56204250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,D8
`Chr4:56204308`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C21,C73
`Chr4:56204308`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C21,C73
`Chr4:56204310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B134,D11
`Chr4:56204311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:56204333`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B41
`Chr4:56204333`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B41
`Chr4:56204433`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A13,A18,A2,A24,A25,A7,A8,A9,B100,B106,B13,B33,B38,B50,B58,B6,B64,B80,B81,B88,B98,C2,C30,C37,C48,C55,C6,C61,C67,C71,C72,C78,C86
`Chr4:56204440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B134,D11
`Chr4:56204548`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A14,A3,A7,B10,B21,B22,B45,B66,B79,C15,C46,C47,C57,C63,C79,C80,C87
`Chr4:56204559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B26,B95,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806088.1

457 aa

228

457

GRAS

PF03514 GRAS 90-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806088.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	90	454	1.7e-65	222.1	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950105.1
GCTGGCCATAGGCTGTCCGGAGCTGGCACGTGGCATATCCTGATTGGTACCATTGCTGTTGGTGAAAGTTGTTTCTCTGAGTAAAGTTCTTGTTACCTTGAGCCAGGGCCACCATGAAATGATCAATTTGTCTCATGTTTTAACTCCAAAAAAGATTTAGTTTTTTCTTCATGCTTTCGATGTTTGCTGTGTTCAAACAGATGCACCACAATGGTAAATATATGTGTGTGGAGATGCAAGAATTTTGTATGAGAATTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021027
ATGGCAGCCAAATGTGGAGGAGAAAATGAGAAAACTCCATGCAATTGTTGTGAAGCAAAGCAAGAAACCTCATCTCCATTCACAATCCTGCATAAGTACCAAAGTCAAGTGAAGCGTTTCAAGCGCGGCAACACCATCACACCGGCCCCCGTGGCCACGCCCCATGCCCAACACCAACACCTGCCATCTGCTGAAGCCATTGTTAGGCTAGCCAAGCTGAGGCTCCTCCACAAAACCCCTCAAGATTCCGAGAATCTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806088.1
MAAKCGGENEKTPCNCCEAKQETSSPFTILHKYQSQVKRFKRGNTITPAPVATPHAQHQHLPSAEAIVRLAKLRLLHKTPQDSENLRDVELVLEAGEKLSQHKFECAEMLLDKCILISDKNAAGGRAVKFFAEALRERLDSETGKIDLERKAFDLEECLLTYQSVILACEDKLPSSQIAQFTAIQAILDSIGSAKTIHLIDFGIKSGLHWSVMIQGLASRGHGRLKITALGSSGDRLEETGRRLSSFAHSMKLPFVFKSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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