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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004149`

染色体: Chr04 坐标: 56211535-56213356 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004149`
名称	SmilChr04G004149
描述	universal stress protein PHOS34
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56211535 - 56213356 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021030`
GeneID	`131021030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021030`
原始查询	`SmilChr04G004149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	universal stress protein PHOS34
产物	universal stress protein PHOS34
Arabidopsis	`AT3G17020` (AT3G17020) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820958] identity=67.3; qcov=0.969; evalue=3.65e-78; confidence=high
Rice	`Os05g0157200` - identity=64.3; qcov=0.975; evalue=1.14e-73; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806090.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806090.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057806090.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057806090.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806090.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56212188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B18,C21,C70
`Chr4:56212887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B82
`Chr4:56212913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B77,C14,C3
`Chr4:56212927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B77,C14,C3
`Chr4:56213052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B131,B137,B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806090.1

161 aa

161

Usp

PF00582 Usp 5-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806090.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	5	158	1.4e-30	107.5	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950107.1
AGAATCACATGAAAAAAAAAAAAGGTTGAATATGGGTGCTTTACAGACACACACAAGCACCAATTCAATTCATAGTAGTATTTAGGTGTTTTCTCTTATAAAGTCAAAATTAATATTTTAAAAAACTATTTAATCTAAAATAATCCAACGGTCAGAATGTAAAGACGATGAGCATGATTAGAATTTGATAGTAGTGTTACAATACTCACTTGTTTTGTCTCGACTTGAACAAACGCACACTACCATCCATTTCCTGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021030
ATGGCAGATTGCAGAAGAGTTGGGGTGGCCGTGGACTTCTCACCGTGCAGCAGGAAAGCTTTGAAGTGGGCTGTTGATAACGTTGCCCGGAGCGGCGATCACCTGATTCTCGTCTCTGTGCGCCCCGAAGGCAACTATGAGGAAGGCGAGATGCAGCTATGGGAGGCCACTGGTTCTCCTTTGATTCCATTGAGCGAGTTCTCGGAACCCCATCTCATGAAGAAATACGGTGTTAGCCCCGATCCAGAGACATTGGACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806090.1
MADCRRVGVAVDFSPCSRKALKWAVDNVARSGDHLILVSVRPEGNYEEGEMQLWEATGSPLIPLSEFSEPHLMKKYGVSPDPETLDIVSTAARQHGIVVVLKIYWGDAREKLVEAVDSIPLDCIVIGNRGLGKIKRVIMGSVSNFVVNSAPCPVTVVKSHD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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